Root

Conocida también como la Fundación, Root nació como un ramal de entrenamiento del Anbu de Konohagakure. Danzō Shimura la creó y la dirigió, usándola para ejecutar cualquier operación que considerara beneficiosa para la aldea. Su doctrina central, llamada la Voluntad de Root, presentaba a sus agentes como las manos ocultas que sostenían el gran árbol de Konoha desde muy por debajo del suelo. Ese credo justificaba una serie de actos terribles, entre ellos el asesinato de personas marcadas como posibles amenazas simplemente por hablar mal de la aldea, incluso cuando no habían cometido ninguna ofensa real contra ella. Por encima de todo el grupo valoraba el secreto, y la mayor parte de su trabajo se desarrollaba en la sombra, sin deber lealtad a ningún eslabón de la cadena de mando de Konoha y protegiendo sus confidencias con aún más celo que el Anbu ordinario. Root se disolvió oficialmente tras la Caída del Clan Uchiha, una catástrofe que el propio Danzō orquestó, aunque continuó en secreto hasta su muerte. Incluso después de que Hiruzen ordenara su cierre, sus miembros se mantuvieron leales a Danzō, anteponiendo su palabra a la del Hokage. Con Danzō fuera, Sai aconsejó a los supervivientes volverse hacia Kakashi Hatake, quien era el siguiente en la línea para el cargo de Hokage.

Root forjaba a sus operativos mediante métodos salvajes. Un sello maldito se estampaba en la parte inferior de la lengua de cada miembro, y en el instante en que uno intentaba revelar algo relativo a Danzō o al grupo, ese sello congelaba todo el cuerpo en rigidez, garantizando que la captura y el interrogatorio no pudieran arrancar ningún secreto. La marca se desvaneció en el momento en que Danzō murió. Para quemar la emoción de ellos, Danzō criaba a sus reclutas lado a lado como hermanos desde la infancia y luego los hacía matarse entre sí, un régimen casi indistinguible de la antigua prueba de graduación de la Academia de Kirigakure. Los miembros respondían a nombres en clave, y muchos de ellos ya no recordaban los nombres con los que habían nacido. En lugar de una katana portaban un tantō sin punta, y bajo la capa y la máscara habituales del Anbu, que no llevaban un uniforme más allá de una chaqueta corta de abdomen al descubierto en negro, equipada con correas rojas a través de los hombros, cada uno se vestía con ropa propia. El grupo también se apoyaba en un lavado de cerebro gradual y prolongado, una vez rehaciendo lentamente una serie de fotografías para que Nonō Yakushi ya no reconociera a Kabuto y actuara en su contra.

El registro de misiones de la organización es largo y turbio. Danzō encargó a Tanuki Shigaraki fabricar el arma Gozu Tennō a partir de células tomadas de Hashirama, envió a Nonō a Iwagakure y infiltró a Kabuto entre las grandes aldeas para espiar antes de tramar que los dos agentes se mataran entre sí. Otros trabajos incluyeron inculpar a Iwagakure para arruinar conversaciones de paz, empujar a Hanzō a una alianza y ordenar a Sai asesinar a Sasuke Uchiha, una asignación de la que Sai al final se desentendió. Mientras Pain arrasaba la aldea, Danzō retuvo a Root de su defensa, apostando a que la calamidad le despejaría el camino al cargo de Hokage. Al partir hacia la Cumbre de Kage, llevó a Fū y Torune como guardias mientras otros agentes seguían a Anko y Kabuto, pero Tobi se llevó a los guardaespaldas y Sasuke atravesó a Danzō antes de que cualquiera de estos planes diera fruto.

Danzō Shimura fundó y comandó Root, eligiendo a mano a sus miembros e inclinándose hacia reclutas de clanes con dones raros, entre ellos los Aburame, Yamanaka y Uchiha. Sai se convirtió en su rostro más familiar, desafiando al final las órdenes de Danzō y más tarde esforzándose por liberar a los miembros restantes de ese legado. En el anime, Yamato fue el único miembro que Danzō entrenó con sus propias manos. Nonō Yakushi, valorada por su habilidad para reunir inteligencia, fue considerada inadecuada porque nunca pudo despojarse de sus sentimientos, y encontró su fin a manos de Kabuto. Kabuto Yakushi espió en nombre de Root antes de desertar junto a Orochimaru. Fū y Torune se erigieron como el par principal y sirvieron de guardias de Danzō, mientras que Tanuki Shigaraki prosiguió con el proyecto Gozu Tennō tras su exilio, transmitiendo su rencor a su hija Sumire. Una vez terminada la Cuarta Guerra Mundial Shinobi, Tsunade junto con Kakashi contuvieron las verificaciones de antecedentes de los aldeanos, permitiendo que antiguos agentes como Kido Tsumiki y Magire se reintegraran en silencio al Anbu regular.