Invasi Flaxan

Setelah pembunuhan Guardians of the Globe, kekuatan alien dari dimensi lain, Flaxans, membanjiri Bumi. Dengan hilangnya para pahlawan veteran, Teen Team yang masih muda dan seorang pemula bernama Invincible dibiarkan menahan garis pertahanan. Para penyerbu menyerang tiga kali, dan pada setiap kesempatan mereka berhasil dipukul mundur. Pada awalnya mereka mundur karena aliran waktu Bumi yang lebih lambat membuat mereka menua hingga mati, tetapi mereka secara bertahap merekayasa penangkal yang membuat setiap gelombang semakin sulit untuk ditahan dibandingkan yang sebelumnya.

Selama serangan pembuka, Flaxans berteleportasi ke pusat kota dan menebas siapa pun dalam jangkauan. Invincible bergegas masuk dan menyelamatkan seorang wanita lanjut usia bernama Maya, meskipun pendaratan yang gagal melukai kakinya dengan parah. Atom Eve tiba untuk menangkis tembakan meriam yang diarahkan kepadanya, dan anggota Teen Team lainnya bergabung dalam pertarungan sebelum Flaxans tumbang akibat penuaan cepat dan melarikan diri.

Tiga hari kemudian gelombang kedua kembali dipimpin oleh Flaxan yang sama yang telah dilukai Invincible, kini diberi penghargaan dan tidak lagi menua. Robot menyimpulkan bahwa mereka telah menemukan cara untuk melawan waktu Bumi, dan para penyerbu, setelah mempelajari kekuatan tim, memperoleh keunggulan. Setelah Flaxan Leader membunuh Atom Eve untuk membalas kekalahan sebelumnya, Invincible yang murka melepaskan diri dan merusak gelang pergelangan tangan pemimpin tersebut, memulai kembali proses penuaannya. Robot melihat kelemahan itu, mengamankan sebuah gelang, membaca frekuensinya sebesar empat puluh sembilan ribu kilohertz, dan memancarkan sinyal yang menghancurkan mereka semua, mengusir Flaxans sekali lagi.

Invasi ketiga tiba dengan kekebalan penuh terhadap aliran waktu Bumi, dengan pemimpin yang memimpin dari dalam sebuah mech yang kuat. Robot menyatakan kota telah hilang dan mengusulkan respons nuklir yang ditolak oleh yang lain. Pemimpin berbalut mech melumpuhkan Invincible dan bersiap menghabisinya hingga Omni-Man menerjang masuk, menepis setiap serangan, dan memaksa para penyerbu mundur.

Alih-alih membiarkan mereka melarikan diri, Omni-Man menerjang Flaxan Leader menembus portal dan menghancurkan dimensi mereka, membunuh pemimpin tersebut, membantai Flaxans yang tak terhitung jumlahnya, dan meratakan kota-kota mereka. Ia memaksa para ilmuwan yang selamat untuk membuka kembali gerbang menuju rumah, lalu menjatuhkan bongkahan tanah yang sangat besar ke atas mereka saat ia terbang melewatinya. Flaxans kemudian terlihat membangun kembali dan merencanakan balas dendam terhadap Omni-Man dan Bumi. Korban termasuk Maya, banyak manusia, tiga ilmuwan Flaxan, dan Flaxan Leader. Peristiwa ini pertama kali muncul pada episode kedua musim pertama.