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漫画『進撃の巨人』の第3のストーリーエピソードで、単行本第4巻に収録された第15話から第18話にあたる。巨人がもたらした惨状に衝撃を受けたエレン、ミカサ、アルミンは軍に入隊し、第104期訓練兵団に加わって同期たちと共に兵士の道の厳しさを学んでいく。

アニメ『進撃の巨人』の第6のストーリーエピソードであり、第23話から第25話にかけて描かれる。アニ・レオンハートがストヘス区の憲兵団に身を置いていた中、おとなしい新兵と女型の巨人が同一人物であると見抜いた調査兵団が罠を仕掛ける。

『進撃の巨人』の漫画における第5のストーリーエピソード（第9巻から第12巻に収録された第35話から第50話までの全16話）。ウォール・ローゼ領内に突如巨人が出現し、新たな壁の突破が懸念される中、その対応に追われる中で第104期生の中に潜んでいた敵の正体が露わになっていく。

アニメ『進撃の巨人』の第7のストーリーエピソード（第26話から第37話）。同名の漫画エピソードをアニメ化したもので、第104期生の新兵たちが巨人のスパイを隠している疑惑で拘留される中、ウォール・ローゼの内部に巨人が出現したとの報が届く。

前日譚漫画『進撃の巨人 Before the fall』の第4ストーリーエピソード（単行本第7巻から第9巻の第21話から第32話）。工業都市の内部で反乱の機運が高まる中、シャビはその裏に潜む運動に潜入し、キュクロは壁の内部に取り残された仲間の元へ到達しようと奮闘する。

アニメ『進撃の巨人』の第4のストーリーアークであり、第14話から第16話で構成される。トロスト区攻防戦が決着し、エレンは調査兵団のリヴァイ班の監視下に置かれ、第57回壁外調査が近づくにつれて焦点は準備へと移行する。

アニメ『進撃の巨人』の第2のストーリーアークであり、第3話と第4話にあたる。シガンシナ陥落をきっかけにエレン・イェーガー、ミカサ・アッカーマン、アルミン・アルレルトは軍を志し、この2つのエピソードでは第104期訓練兵団への入隊と訓練期間の日々が描かれる。

『進撃の巨人 LOST GIRLS』の第2章にして最終エピソード。単行本第2巻に収録され、2016年1月から4月まで連載された。巨人が侵攻してこなかった世界をミカサ・アッカーマンが夢見る姿を描き、そこでは両親が生存しており、幼いエレンが外の世界への憧れを抱き続けている。

『進撃の巨人』の第8の漫画アークは海を渡り、敵国マーレの内部で展開する。第91話から第106話まで連載され、巨人の優位性が薄れつつあることを自覚する軍事大国マーレと、彼らが必要とする「始祖の巨人」を保持したままパラディ島に留まるエレン・イェーガーの姿を描く。

全9話にわたり舞台は敵地へと移る。アニメ『進撃の巨人』は第10のエピソードとしてマーレに到達する。国外での戦争が終結したばかりのマーレでは、指導層が巨人の優位性の陰りを感じており、エレン・イェーガーから「始祖の巨人」を奪還することが帝国の最優先事項となる。

漫画『進撃の巨人』がその舞台を設定するのに必要なのは、わずか2話であった。壁に囲まれた人類、生まれ育った街よりも大きな夢を抱く3人の子供たち、そしてシガンシナ区に立ちはだかる超大型巨人。序章は2009年秋に本シリーズの連載を開始させた。

前日譚『進撃の巨人 Before the fall』の第6エピソードでは、壊滅状態となった兵団の再建が中心となる。キュクロ、新たな訓練兵たち、そして元隊長のホルヘ・ピケールは新型の立体機動装置を中心に結束するが、目前に迫る壁外調査には隠された脅威が潜んでいた。

全20話にわたり、調査兵団は物語が始まった場所へと戻る。漫画『進撃の巨人』の第7のストーリーエピソードでは、ハンジ・ゾエの新兵器に支えられながらシガンシナ区を奪還する作戦が展開される一方、廃墟の中には兵士たちが熟知する宿敵たちが待ち受けている。

失われた人類の故郷を取り戻す戦いが全10話で描かれる。アニメ『進撃の巨人』の第9のストーリーエピソードにあたり、ハンジ・ゾエの新兵器が初の本格的試練に挑み、長年の宿敵たちが待ち受けるシガンシナ区奪還を目指す調査兵団の任務を追う。

ニック司祭の殺害と拉致未遂事件をきっかけに、調査兵団は自らの支配者層との対立へと追い込まれる。2013年から2015年にかけて発表された全20話にわたり、漫画の第6のストーリーエピソードでは、王政を打倒しヒストリア・レイスを即位させようとするエルヴィン・スミスの計画が描かれる。

全12話にわたり、物語は内政問題へと展開する。アニメの第8のストーリーエピソードでは、ニック司祭の殺害とエレン・イェーガーおよびヒストリア・レイスの拉致未遂事件の波紋が描かれ、王政が人類を危険に晒していると判断したエルヴィン・スミスは、ヒストリアを女王に即位させるべくクーデターに賭ける。

自分が何者であるかを知りたいというキュクロの欲求が『Before the fall』の第2エピソードを突き動かす。シャルルと共にシガンシナ区に到着した彼は、自らに巨人の血が流れているか確かめるため壁の外へ忍び込み、人間であることの証明を得た直後、嘘に基づく死刑宣告を受けることになる。

『Before the fall』は、2018年7月から2019年3月にかけて発表された全9話の「生存遠征編」をもって完結する。再編された調査兵団がついに壁外へと出撃するが、兵団の生存は未だ実戦経験の乏しい新兵たちに委ねられている。

全6話にわたり、破滅的な結末を辿る遠征を描く。アニメの第5のストーリーエピソードにおいて、調査兵団はカラネス区からシガンシナ区を目指して出撃するが、生のまま捕獲することを狙う標的エレン・イェーガーを追って、女の姿をした巨人が陣形の右翼を襲撃する。

アニメは、たった一日で幼少期を終わらせる2つのエピソードから幕を開ける。エレン・イェーガーと、その友人であるミサカ・アッカーマン、アルミン・アルレルトは、人類の「壁」の内側で安全に暮らし、外の世界に思いを馳せていたが、超大型巨人がシガンシナ区の門を打ち破ったことでその平穏は打ち砕かれる。

『進撃の巨人』の漫画の第4編となるストーリーアークで、第19話から第34話まで展開する。調査兵団のリヴァイの指揮下に配置されたばかりのエレン・イェーガーは壁外調査へと出発するが、そこでは知性と予測不能な行動を備えた敵、女型巨人が陣形を待ち受けていた。

アニメ『進撃の巨人』の第3のストーリーエピソード（第5話から第13話）。卒業したばかりの第104期訓練兵団は、超大型巨人がトロスト区の壁を破壊したことで突如実戦に投入され、その混乱の中でエレン・イェーガーは自らに眠る奇妙な力を発見する。

スピンオフ漫画『進撃の巨人 Before the fall』の最初のストーリーエピソード。巨人の犠牲となった妊婦の胎内から生きて引き揚げられた赤ん坊は、「巨人の子」として忌み嫌われ育つが、シャルル・イノセンシオとの絆によって、キュクロはシガンシナ区を目指して逃亡する理由を得る。

スピンオフ漫画『進撃の巨人 Before the fall』の第5のストーリーエピソード。ついに兄の束縛から解放されたシャルル・イノセンシオは、発明家アンヘル・アールトネンが暮らしているという噂を追い、ストヘス区の地下に広がる地下街へと降り立つ。一方、キュクロはシャルビとの決闘の末、見知らぬ場所で目を覚ます。

前日譚漫画『Before the fall』の第3エピソード。ホルヘ・ピケールによってシガンシナ区から極秘に連れ出されたキュクロとカルディナ・バウマイスターは工業都市に潜伏する。そこで対巨人用の装置の噂を聞いたキュクロは調査兵団を目指すようになり、一方でシャビはシャルルの足取りを掴む。

漫画『進撃の巨人』の第2のストーリーエピソード（第3話から第14話および外伝を収録）。第104期訓練兵団の卒業直後、超大型巨人がトロスト区の壁を破壊し、その戦いの中でエレン・イェーガーの隠された能力が公となる。

スピンオフ漫画『進撃の巨人 LOST GIRLS』の幕開けとなるエピソード。調査兵団に潜入する前の最後の自由な日に、アニ・レオンハートはストヘス区で失踪した若い女性カーリー・ストラットマンを捜索するが、その依頼は想定を遥かに超えるトラブルへと彼女を引き込んでいく。

漫画『進撃の巨人』の第9番目にして最終エピソード（第107話から第139話）。レベリオ襲撃を経てパラディ島に戻った調査兵団は、エレンを中心に据えたエルディア帝国の建国を掲げる反逆勢力「イェーガー派」と対峙し、同時にマーレも島への壊滅的な攻撃の準備を進める。

アニメ『進撃の巨人』の第11番目のストーリーエピソードであり、最終章。レベリオ襲撃を終えた調査兵団はパラディ島へと帰還するが、エレン・イェーガー率いるエルディア帝国の再興を目指す反乱勢力「イェーガー派」に直面し、同時にマーレも島への報復に向けて動き出す。