Raiz

Conhecida também como Fundação, a Raiz surgiu como uma ramificação de treinamento da Anbu de Konohagakure. Danzō Shimura a criou e a comandou, utilizando-a para executar qualquer operação que considerasse benéfica para a vila. Sua doutrina principal, apelidada de Vontade da Raiz, definia seus agentes como as mãos ocultas que sustentavam a grande árvore de Konoha muito abaixo do solo. Esse credo justificava uma série de atos sórdidos, entre eles o assassinato de pessoas marcadas como possíveis ameaças simplesmente por falarem mal da vila, mesmo quando não haviam cometido nenhuma ofensa real contra ela. Acima de tudo, o grupo valorizava o sigilo, e a maior parte de seu trabalho ocorria nas sombras, sem prestar contas a nenhum elo da cadeia de comando de Konoha e protegendo seus segredos de forma ainda mais zelosa do que a Anbu comum. A Raiz foi oficialmente encerrada após a Queda do Clã Uchiha, uma catástrofe que o próprio Danzō orquestrou, embora tenha continuado a funcionar em segredo até a sua morte. Mesmo depois de Hiruzen ordenar seu fechamento, seus membros permaneceram leais a Danzō, colocando sua palavra acima da do Hokage. Com a morte de Danzō, Sai aconselhou os sobreviventes a procurarem Kakashi Hatake, que era o próximo na linha de sucessão ao cargo de Hokage.

A Raiz forjava seus operativos por meio de métodos selvagens. Um selo amaldiçoado era estampado na parte inferior da língua de cada membro, e no instante em que alguém tentava divulgar qualquer coisa sobre Danzō ou o grupo, esse selo paralisava o corpo inteiro, garantindo que capturas e interrogatórios não pudessem extrair nenhum segredo. A marca desapareceu no momento em que Danzō morreu. Para erradicar as emoções deles, Danzō criava seus recrutas lado a lado como irmãos desde a infância e depois os fazia massacrar uns aos outros, um regime quase indistinguível do antigo teste de graduação da Academia de Kirigakure. Os membros respondiam a codinomes, e muitos deles já não se lembravam dos nomes com os quais haviam nascido. Em vez de uma katana, eles carregavam uma tantō sem ponta, e sob a capa e máscara usuais da Anbu, que não exigiam uniforme além de uma jaqueta curta preta com tiras vermelhas nos ombros, cada um vestia suas próprias roupas. O grupo também recorria a uma lavagem cerebral gradual e prolongada, tendo uma vez alterado lentamente uma série de fotografias para que Nonō Yakushi não reconhecesse mais Kabuto e agisse contra ele.

O histórico de missões da organização é longo e obscuro. Danzō encarregou Tanuki Shigaraki de criar a arma Gozu Tennō a partir de células retiradas de Hashirama, enviou Nonō para Iwagakure e infiltrou Kabuto entre as grandes vilas para espionar antes de planejar fazer com que os dois agentes se matassem. Outros trabalhos incluíram incriminar Iwagakure para arruinar negociações de paz, induzir Hanzō a uma aliança e ordenar que Sai assassinasse Sasuke Uchiha, uma missão da qual Sai acabou desistindo. Enquanto Pain devastava a vila, Danzō manteve a Raiz afastada da defesa, apostando que a calamidade abriria seu caminho para o cargo de Hokage. Ao partir para a Cúpula dos Kage, ele levou Fū e Torune como guardas enquanto outros agentes seguiam Anko e Kabuto, mas Tobi capturou os guarda-costas e Sasuke empalou Danzō antes que qualquer um desses planos pudesse dar frutos.

Danzō Shimura fundou e comandou a Raiz, selecionando a dedo seus membros e dando preferência a recrutas de clãs com dons raros, entre eles os Aburame, Yamanaka e Uchiha. Sai tornou-se sua face mais conhecida, acabando por desafiar as ordens de Danzō e, mais tarde, esforçando-se para libertar os membros remanescentes desse legado. No anime, Yamato foi o único membro que Danzō treinou com as próprias mãos. Nonō Yakushi, valorizada por sua habilidade na coleta de informações, foi considerada inadequada por nunca conseguir se livrar de seus sentimentos, e encontrou seu fim nas mãos de Kabuto. Kabuto Yakushi espionou em nome da Raiz antes de desertar ao lado de Orochimaru. Fū e Torune formavam a dupla principal e atuavam como guardas de Danzō, enquanto Tanuki Shigaraki deu continuidade ao projeto Gozu Tennō após seu exílio, transmitindo seu rancor à sua filha Sumire. Assim que a Quarta Grande Guerra Shinobi terminou, Tsunade, juntamente com Kakashi, suspendeu as verificações de antecedentes dos moradores, permitindo que ex-agentes como Kido Tsumiki e Magire voltassem discretamente para a Anbu regular.