日本搜查本部

由L在确定日本为基拉的基地后创立，搜查本部是该国唯一致力于该案件的力量。它以几个名字为人所知，包括基拉对策室和基拉特别搜查队，它在东京运作，其存在不向公众公开，并且每个成员的身份都受到保护。L死后，夜神月继承了这个组织和L的化名，该单位在案件最终结束后被认为已解散。

当日本警察厅意识到这项任务有多么致命时，几乎所有的警官都退出了，只剩下一小批核心人员同意与L面对面会面。起初，他们错开时间在不同的酒店轮转，直到L的大楼建成。他的策略，窃听两名警官的家庭，将夜神月、弥海砂和夜神总一郎拘留，以及雇佣一名骗子和一名窃贼，使得他与警方的关系变得紧张。来自警察厅的资金压力迫使成员在案件和他们的工作之间做出选择。相泽修一在与L发生冲突后离开，但他和伊出英基悄悄地利用部门资源帮助将火口卿介逼入绝境，之后团队将找回的笔记本保存了五年。

时间跳跃之后，夜神月承担了该组织和L的身份。警察厅长官多木村管一以及夜神妆裕的被绑架，促使相泽和伊出全职回归，小队参与了对黑手党基地的突袭，夜神总一郎在那里受了致命伤。在与尼亚接触后，对夜神月日益增长的怀疑最终将搜查本部和尼亚的基拉对策密室引向了黄色盒子仓库。在那里，魅上照记录下了在场除了尼亚以外所有人的名字，但尼亚的反击揭穿了夜神月并结束了基拉案。

该单位的创始人兼第一任领导者是L，他以龙崎的化名工作，并被认为是世界上最伟大的侦探。日本警察厅刑事局局长夜神总一郎领导最初的警官们，他是夜神月的父亲，而夜神月就是那个为了得知L的真名而加入的隐藏的基拉。资深队伍中包括沉默寡言的模木完造、渴望表现的年轻的松田桃太、负责协调的伊出英基、容易情绪化的宇生田广数，以及后来自己成为警察厅长官的相泽修一。L还依赖他的代理人渡进行后勤工作，并请来骗子艾尔伯和女飞贼温蒂从事专业工作。改编作品增加了他们自己的面孔，其中包括电影中的佐波和电视剧中的日村章子。