莉莉丝

莉莉丝呈现为一具巨大的人形躯干，大小与EVA相当，皮肤苍白而松弛，性别特征不明。以2015年所见的形态来看，它完全没有臀部与双腿，躯干末端为不定形的肉块，其上长出数十对与人类等大的腿。它悬挂于中央教条区，被钉穿手掌固定在巨大的红色十字架上，胸口则被朗基努斯之枪贯穿。在第22话中零号机拔出长枪后，缺失的下半身重新生长出来，大腿处仍拖曳着成簇的小腿。

其最引人注目的特征是固定于面部的紫色面具，面具上开有七个眼孔，分两列不均匀排列，右侧三个，左侧四个，并刻有倒三角形纹样。该面具究竟是天然骨板还是人工拘束具，始终未有定论，但SEELE将其蒙面形象用作组织徽记。LCL，也就是莉莉丝的血液，沿十字架持续流下，在下层汇成人工湖泊，所有插入栓中的液体最终皆源于此。

莉莉丝从未显露出任何类似意志的迹象。它无力地悬挂在十字架上，一动不动，毫无反应，既不对利用它的研究人员作出回应，也不对上方震动城市的战斗有所反应。作为生命之种所承载的意识始终处于隐藏状态，直至第三次冲击时，它与绫波丽融合而成的存在才以明确的意图展开行动。

数十亿年前，第一始祖民族将生命之种散播到宇宙各处。搭载莉莉丝的黑之月在被称为第一次冲击的碰撞中纯属意外地撞击地球，削出月球并摧毁了本应随行的长枪。地球上已存在名为亚当的生命之种，两个生命之种本不应共享同一颗行星，由于莉莉丝的长枪已毁，仅存的亚当之枪启动，通过迫使亚当进入休眠来化解冲突。莉莉丝因此得以自由地以原始汤播种这颗星球，由此演化出普通的地球生命，这一脉系最终发展为人类，即莉莉姆，取代了亚当的子嗣使徒，成为地球的优势种族。

漫长的地壳漂移将埋藏的黑之月带至未来箱根所在地的地下，其空洞内部形成了后来被称为GeoFront的巨大空洞。SEELE找到了它，并在其正上方建立了Gehirn总部，随后是NERV总部与第三新东京市，将被囚的使徒变为基础设施，一口可再生的LCL之井、实验对象，以及为人类补完计划准备的触发装置，其生长被有意以回收的亚当之枪钉穿而抑制。除了一台之外，所有EVA均复制自亚当，唯有初号机源自莉莉丝，第23话中的画面暗示该机体是从使徒下半身被强行撕离的，这也解释了其下半身明显缺失的原因。

在新世纪福音战士剧场版：Air/真心为你中，碇源堂将移植于手中的亚当胚胎强行植入第三个绫波丽体内，企图支配莉莉丝并与唯重逢。绫波丽拒绝了他，携带着亚当的肉体与灵魂进入中央教条区，与莉莉丝融合，进入时成簇的小腿随之消失。由此诞生的巨人顶着绫波丽的面容，发动了第三次冲击与人类补完。碇真嗣最终拒绝了融合的存在，初号机从巨人的眼部撕裂而出并折断朗基努斯之枪，庞大的躯体随之崩解坠落大地，似乎已失去生命。漫画版遵循相同脉络，在真嗣作出选择后莉莉丝便悄然消失。