第一天

作为FA系列的第二集，也是首集直接取材自漫画的篇章，本章以驶向里奥尔的列车之旅为框架，讲述兄弟二人的起源。它回顾了夺走母亲的疫病、让阿尔冯斯失去全身并令爱德华失去一条腿的灾难性人体炼成，以及将弟弟灵魂束缚于铠甲之中的绝望之举。此后则讲述爱德华被招入军队并晋升为钢之炼金术师的历程。

兄弟二人在童年便展现出罕见的炼金天赋，但母亲不久后在疫病中去世，他们不愿等待杳无音讯的父亲，决意将她带回。禁忌的仪式遭到反噬，将爱德华拉入一片白色虚空，面见名为真理的存在，海量知识被强行灌入他的脑海，他的腿被夺走，而阿尔冯斯的整个身体则被拖走。在血泊中独自面对毫无生气的失败造物，爱德华以自身为代价，用血印将弟弟的灵魂固定于一套空铠甲之上。在当前时间线的四年前，马斯坦与霍克艾为物色人才来到里森布尔，发现血染的炼成阵以及重伤的爱德华与被束于铠甲中的阿尔冯斯。上校不顾萍娜可的反对，向兄弟二人说明国家炼金术师制度能为他们提供恢复身体的途径，而莉莎则告诉年幼的温莉，选择权只在兄弟二人手中。经历艰苦的机械铠手术与康复并将其压缩至一年内完成，爱德华学会了无需画阵即可发动炼成，随后前往中央，在考核中对大总统布拉德雷发动佯攻，从而获得资格并被授予钢之炼金术师之名。黎明时分，列车抵达里奥尔，贤者之石或许就藏于其中。

本集融合了五章漫画内容，标题卡将兄弟二人的人体炼成阵与马斯坦的火焰炼成阵并置。伊兹米在此首次登场，不过仅作为真理之门中承载知识的幻象之一，并未以具名角色出现。本集还包含了对炼丹术的最早提及，由休斯将关于艾萨克·麦克杜加尔的报告交给马斯坦时带出，这一提及为第二部动画独有，因为麦克杜加尔仅在FA中登场。