鼬追捕行动

该故事线在动画中被称为“师父的预言与复仇”，覆盖漫画第343话至第367话（单行本第38卷至第40卷），对应动画火影忍者疾风传第113集至第118集以及第121集至第126集。漫画接续晓镇压任务，动画接续三尾现身，两者均延续至自来也豪杰物语。其双线叙事跟随宇智波佐助与漩涡鸣人，两人出于不同原因，各自出发寻找宇智波鼬。

宣称已从大蛇丸处学无所学后，佐助向衰弱的大蛇丸发起反叛，逼得他抛弃渐朽的躯壳，现出蛇形真身。当被剧毒削弱的少年被整个吞下、即将被强行转生时，佐助反而以自己的瞳力夺取领域，将术式反施于施术者，就此将大蛇丸击溃。随后他解放了鬼灯水月，招募了感知型忍者香燐，又压制了暴戾的重吾，组成了以“蛇”为名的小队，并宣告唯一的目的：诛杀自己的哥哥。

木叶村里，大蛇丸死讯传来，漩涡鸣人与春野樱确信宇智波佐助紧接着便会猎杀宇智波鼬，于是卡卡西班与第八班决意抓获那位年长的宇智波，并循线追到同伴身边。药师兜拦下鸣人一行，递上一份关于晓的档案，并感谢鸣人帮自己找到应行的路，同时透露他已将大蛇丸的部分遗骸融入体内。随着双方各自展开情报收集，两场追捕开始向同一目标收拢。

迪达拉与阿飞伏击佐助，随即展开一场漫长的爆破对决。战斗中迪达拉回忆起自己因败于宇智波鼬的写轮眼而被强迫加入晓的往事。被逼至绝境的迪达拉将自身化为活体炸弹，但佐助通灵出万蛇作为盾牌，并以牺牲万蛇为代价传送脱身。与此同时，宇智波鼬分派出两具分身，一具缠住鸣人，以短暂幻术对话提及他与佐助的羁绊，另一具则试探佐助，随后指引他前往附近的一处宇智波据点。

双方队伍都向会合点进发。鸣人一行被阿飞拖住，干柿鬼鲛则出手牵制“蛇”小队的其余成员，让鬼灯水月与之争夺鲛肌。同伴皆被阻拦后，佐助独自前行，为与宇智波鼬的对决做好了觉悟，而这正是整场追捕行动的最终目标。