寻找纲手

这一第一部故事线标志着晓的首次登场，并让自来也和大蛇丸各自争相先找到纲手。内容跨越第16至19卷，涵盖漫画第139至171话，动画第81至100集。在此之前的篇章是木叶毁灭行动。漫画直接衔接到宇智波佐助夺还任务，而动画则穿插了茶之国护送任务作为支线。该任务被评定为B级，开启了漩涡鸣人修炼螺旋丸的道路。

木叶村仍因入侵失败而动荡不安，并在悼念第3代火影之际，长老们请求自来也接任火影之位。他拒绝了，转而推荐同门的纲手，并带着漩涡鸣人动身寻找她，同时承诺教这孩子新术。与此同时，晓的两名成员干柿鬼鲛和宇智波鼬潜入村内。他们压制了猿飞阿斯玛和夕日红，甚至连旗木卡卡西也败在宇智波鼬的月读之下，直到迈特凯将二人逼退。他们的目标最终被发现是封印在漩涡鸣人体内的九尾。

宇智波佐助发现哥哥再度现身时，立刻冲向漩涡鸣人，迫切想了断彼此的恩怨。宇智波鼬和干柿鬼鲛在一处旅店堵住了漩涡鸣人，但自来也从设计引开他的幻术里挣脱出来，拦下了攻击。宇智波佐助不顾一切扑向宇智波鼬，却被月读重创，精神陷入崩溃。两名杀手不愿与自来也正面交锋而撤退，迈特凯将身心俱碎的宇智波佐助送回了家，这让自来也确信只有纲手才能治好宇智波佐助和旗木卡卡西。

在旅途中，自来也开始传授漩涡鸣人螺旋丸。大蛇丸因弑杀第3代火影而双臂残废，同样在追着纲手，只有她能恢复那双手。他先一步找到了纲手，深知她怕血，又痛失过弟弟和恋人，便用复活那二人的承诺来引诱她协助自己，给她一周时间考虑。自来也和漩涡鸣人随后赶到，并以第1代火影的项链作为赌注，赌漩涡鸣人能否在同一周内掌握螺旋丸。

在诱惑与良知的挣扎中，纲手最终拒绝了大蛇丸。当他的助手药师兜从她治疗的举动中察觉到杀意后，战斗旋即爆发。药师兜极难对付，他利用了纲手的恐血症，直到漩涡鸣人用一团完整的螺旋丸击中他，自己却因心脏遭到致命反击而倒下。这孩子酷似她逝去的至亲，又绝不放弃自己的梦想，纲手深受打动，不仅救活了他，还将项链挂在了他的脖子上。大蛇丸扑向虚弱的漩涡鸣人要取其性命时，纲手以身挡刀，战胜了对血的恐惧，并承袭了第5代火影的名号。随后，三忍各自召唤出万蛇、蛞蝓和蛤蟆文太，展开了一场惊天动地的对决，最终大蛇丸落败，被迫撤退。

回到木叶村后，纲手治愈了宇智波鼬对宇智波佐助和旗木卡卡西造成的精神创伤。她检查了李洛克的脊柱伤势，并警告说，只有她能做的矫正手术，成功率和致死率各占一半，不过她私下的估算已悄悄提升了活命的机会。动画中，第3代火影的孙子木叶丸起初对由新领袖接任十分抵触，直到他无意中听到纲手对李洛克由衷的关切，态度才软化了。就在纲手正式就任前，静音瞥见桌上那张生存率被向上修正了的图表，不由得微微一笑。