Encuentro

Eligiendo complacer a Naruto, Nagato relata cómo llegó a liderar a Akatsuki. Su infancia en Amegakure se desarrolló en medio de un conflicto que Konohagakure había llevado a su tierra natal. Un día, un par de shinobi de Konoha se abrieron paso a la fuerza en la casa de su familia en busca de comida. Su padre quería que se escabulleran sin ser vistos, pero el niño derribó un jarrón. Los intrusos atacaron, y su madre se lanzó sobre él. Después de que ambos padres cayeran por los kunai, los shinobi comprendieron demasiado tarde que habían matado a inocentes e intentaron disculparse. Dominado por la rabia, el joven Nagato despertó su Rinnegan y abatió a ambos.

Solo y hambriento, Nagato deambuló por las calles hasta desmayarse bajo la lluvia. Un perro callejero al que llamó Chibi lo revivió, y los dos vagaron juntos. Cuando el hambre casi los venció de nuevo, una niña llamada Konan les dio pan y los llevó al refugio que compartía con un niño llamado Yahiko. Yahiko admitió que la comida provenía del robo, un mal inevitable necesario para seguir vivos. Mientras los tres huérfanos y Chibi continuaban robando, Yahiko compartió su ambición de convertirse en un dios que reharía el mundo y erradicaría la guerra y la necesidad. Su conversación se interrumpió por un kunai con un sello explosivo que cayó desde arriba. Los niños escaparon de la explosión, pero Chibi no, y mientras Nagato y Konan se afligían, Yahiko rastreó el arma hasta un enfrentamiento entre Hanzō, gobernante de Ame, y los tres legendarios Sannin.

Yahiko resolvió que debían buscar a los Sannin y que les enseñaran ninjutsu para poder defenderse. Después de devolver lo que habían tomado, quedándose solo con la comida que se echaría a perder, el trío avanzó a través del campo de batalla. Una explosión casi los alcanza, pero Nagato protegió al grupo con su Rinnegan, y finalmente llegaron a una cueva donde los esperaban los tres Sannin. Una nota al margen señala que Gamabunta aparece solo marginalmente más grande que Gamamaru aquí, mientras que en la Parte I el sapo se alzaba tan alto como Shukaku de Una Cola, empequeñeciendo el bosque.