ミツキ失踪編

第71話から第92話にわたるこのエピソードは、チョウチョウ編に続き、親子の日編へと繋がる。物語の主軸はミツキの木ノ葉隠れの里からの離脱と、彼を連れ戻すためにチームメイトが行う追跡であり、五影会談や木ノ葉への突然の襲撃と絡み合って展開する。

ミツキは初めての夢から覚め、自分が夢を見られることに驚き、雷バーガーで友人たちとその奇妙な体験を共有し、親に反抗したいと思ったことが一度もないと打ち明ける。シカダイが孵化直後に刷り込みを受けたヒナ鳥を連れて現れると、ミツキはその絆を、兄や父親ではなくボルトについていくという自身の選択になぞらえる。第七班が大筒木一族に関する議題を持つ五影会談の護衛に任命され、現役の影たちがカカシ、メイ、エーを招き入れる一方、オオノキが不在だったため、木ノ葉の忍たちは里を徘徊する土影を捜索することになる。世界で一番硬い石についてナルトが出したなぞなぞに答えたいボルトはオオノキを見つけ出し、老影は下忍たちが彼を案内するなら答えると約束する。

案内中、オオノキは塵遁を使って落下する梁から村人を守り、その負担で倒れてしまう。目を覚ました彼はボルトを若くして亡くした孫のコヅチと間違え、世界で一番硬い石とは忍の曲げられない意志であると明かす。彼はミツキに自身の意志について問い詰めるが、少年は答えることができない。その後まもなく、ミツキは自分のアパートに何者かが侵入し、ベッドに手紙が残されているのを見つけ、それを燃やす。翌日の夜明け、門番のウオとサオが襲撃され、ミツキ自身が雷遁でウオを打ち倒す。警務部隊が現場を捜査する中、サイは木々の間に捨てられた額当てを発見する。

木ノ葉丸は回収された額当てがミツキのものであると特定し、いのが昏睡状態の門番たちの心を読んだ結果、ミツキが岩隠れの2人の忍と共に門番たちを打ち倒したことが判明する。ナルトはミツキが戻るまで里の封鎖を命じるが、ボルトとサラダは自分たちで友人を連れ戻すことを決意する。ナルトが黒ツチに連絡を取ると、彼女は忍を派遣していないことを確認し、岩隠れの里で3人のうち誰かが見つかった場合は木ノ葉に送り返すと約束したため、若い忍たちは自分たちだけでミツキの足跡を追うことになる。