かつてない程の危機

恐竜族の長「古代王」が姿を現すが、タツマキが隕石を落として一瞬で退治する。道場では、バングがかつての筆頭弟子であるガロウが暴れ回り他の弟子たちを全滅させた過去をサイタマとジェノスに語っていた。そこへ協会の職員が現れ、非常事態が発生したとしてすべてのS級ヒーローを緊急招集する。会場でサイタマは傲慢なアトミックサムライをはじめとする最高峰のヒーローたちと出会い、シッチは地球の存亡に関わる重大な危機を告げる。予言的中率100%を誇る大予言者・シババワ様が「地球がヤバイ!!」という遺言を遺して喉を詰まらせて急死したため、今後6ヶ月以内に重大な災厄が訪れると警告する。

直後、本部上空に天空族が現れるが、暗黒盗賊団ダークマターのメルザガルドによって惨殺され、巨大宇宙船の砲撃によってA市が一瞬にして壊滅する。アトミックサムライの弟子・イアイアンは一般人を守るためメルザガルドと交戦するが、無限の再生能力を持つ敵に攻撃が効かず左腕を失ってしまう。そこへアトミックサムライ、金属バット、バング、ぷりぷりプリズナーが駆けつけ、ぷりぷりプリズナーは「エンジェルスタイル」に変身して挑む。地上でヒーローたちが宇宙船への対処に苦慮する中、ジェノスはサイタマがすでに宇宙船内へ侵入し敵をなぎ倒していることに気づく。サイタマは最上級戦闘員のグロリバースを一撃で葬り、玉座で待つボロスの元へと奥深く進んでいく。

シババワ様の死と予言によって事態が動き出し、ダークマターの襲来によって宇宙人の侵略が始まる。多くのS級ヒーローが会議に顔を揃え、イアイアンがメルザガルドに腕を奪われる中、サイタマは単身宇宙船へ潜入して敵を撃破していき、ラストではボロスの姿が明かされる。

タツマキと古代王の対決、金属バットとタツマキの口論、ヒゲ職員の本部でのやり取りなど、アニメオリジナルの場面が多く追加されている。原作漫画ではガロウの名前のみが語られて姿は描かれておらず、イアイアンとメルザガルドの戦闘も原作では瓦礫から立ち上がったイアイアンが奇襲される展開であり、親子を守るために腕を落とされるアニメ版とは異なっている。