चौथा शिनोबी विश्व युद्ध: चरम

अध्याय 560 से 639 तक, खंड 59 से 67 में फैली और Naruto: Shippuden के एपिसोड 322 से 348 तथा 362 से 375 में रूपांतरित, संघर्ष का यह भाग एक साथ कई मोर्चों पर आगे बढ़ता है। विश्व युद्ध के जारी रहने के बीच मित्र शिनोबी सेनाएँ Kabuto Yakushi, Tobi और पुनर्जीवित Madara Uchiha के विरुद्ध अपना संघर्ष तेज करती हैं। यह Confrontation की कथा के बाद आती है और Ten-Tails के Jinchuriki के जन्म की ओर ले जाती है, हालाँकि एनीमे में दोनों के बीच स्वतंत्र उपकथाएँ और Kakashi के मुखौटाधारी अतीत पर एक पुनरावलोकन जोड़ा गया है।

Kabuto द्वारा नव-पुनर्जीवित और उन्नत किए गए Madara चौथे डिवीजन को तबाह कर देते हैं, संयुक्त हमलों को निष्फल करते हुए आकाश से दो उल्कापिंडों को नीचे खींच लाते हैं। पाँच Kage हताशापूर्ण स्थानांतरण तकनीकों के माध्यम से उन पर एकजुट होते हैं, जहाँ Tsunade अपनी सौ-शक्ति पुनर्जनन तकनीक का अनावरण कर इस किंवदंती से लोहा लेती हैं। अन्यत्र Naruto और Killer B, Tobi द्वारा नियंत्रित Jinchuriki से युद्ध करते हैं, और Naruto बारी-बारी से प्रत्येक बंदी पूँछ वाले पशु को मुक्त करने का प्रयास करता है, Son Goku से क्षमा माँगता है और अन्य को मित्रता में जोड़ता है। जब Kurama अंततः स्वेच्छा से अपनी शक्ति प्रदान करता है, तो Naruto मुहर खोलता है, पूर्ण रूपांतरण में प्रवेश करता है और प्रत्येक पशु को नाम से संबोधित करता है, अंततः लोमड़ी को केवल एक हथियार के रूप में देखने से इनकार कर देता है।

तीसरे मोर्चे पर भटकते हुए Sasuke का सामना अपने पुनर्जीवित भाई से होता है, और दोनों अनिच्छा से Kabuto के विरुद्ध गठबंधन करते हैं, जिसने Orochimaru की विरासत को अपना लिया है और Ryuchi Cave की ड्रैगन ऋषि अवस्था प्राप्त कर ली है। Kabuto अपने एकत्रित प्रयोगों और Sound Four की संरचनाओं से उन पर आक्रमण करता है, किंतु Itachi भाग्य को बदलने वाली Izanami को सक्रिय करता है, जो प्रतिद्वंद्वी को तब तक अंतहीन चक्र में फँसाए रखती है जब तक वह अपने वास्तविक स्वरूप को स्वीकार नहीं कर लेता। संघर्ष के बीच Kabuto के अनाथ बचपन, Root द्वारा उसके हेरफेर और Orochimaru द्वारा उसके बचाव की कथा सामने आती है। कार्य करने के लिए स्वतंत्र होकर Itachi मुहर के संकेत निकालता है और Impure World Reincarnation को समाप्त कर देता है, युद्ध भर में आहूत प्रत्येक आत्मा को मुक्त करते हुए Sasuke को स्नेहपूर्ण विदाई देता है।

पुनर्जीवित टुकड़ियों के लुप्त होने के साथ Naruto, Kakashi और Guy, Tobi को घेर लेते हैं, और Naruto का क्लोन साझा विकृत आयाम के भीतर उस पर घात लगाकर उसके मुखौटे को तोड़ देता है। मुखौटे के नीचे का चेहरा Obito Uchiha का है, जो तीसरे शिनोबी विश्व युद्ध में मृत माना गया Kakashi का साथी था। फ्लैशबैक में पता चलता है कि कैसे वृद्ध Madara ने Obito को बचाया और पुनर्निर्मित किया, कैसे Rin की मृत्यु को देखकर वह टूट गया, और कैसे उसने वास्तविकता को पुनर्निर्मित करने की योजना को अपना लिया। Madara मैदान पर पुनः प्रकट होता है, और उनके संयुक्त हमलों के बाद Demonic Statue परिपक्व होकर पुनर्जीवित Ten-Tails में बदल जाता है।

Itachi के प्रतिकार के स्रोत की खोज में Orochimaru, Konoha के भीतर पिछले Hokage को पुनर्जीवित करता है ताकि Sasuke उनसे प्रश्न कर सके, Hashirama द्वारा Madara के साथ अपने बंधन और शिनोबी के वास्तविक स्वरूप का वर्णन युवा Uchiha को उस गाँव के लिए लड़ने के लिए प्रेरित करता है जिसकी रक्षा में उसके भाई ने प्राण दिए थे। जब Ten-Tails प्राकृतिक आपदाओं से युद्धक्षेत्र को तबाह करता है और Neji को मार देता है, तो Hinata, Naruto को संभालती है, जो Kurama के चक्र को पूरे गठबंधन के साथ साझा करता है। Team 7 पुनः एकजुट होती है, पुनर्जीवित Hokage पशु को सील करने के लिए पहुँचते हैं, और आहूत Kage के समन आक्रमण में शामिल होते हैं, जबकि Madara, Obito को Ten-Tails का मेजबान बनने के लिए विवश करता है और युद्ध के अंतिम चरण के लिए मंच तैयार करता है।