दो शिष्य

Sakura, Hinata की चोटों की देखभाल करती है और Naruto के प्रति उसके प्रेम की गहराई पर विचार करती है, जो Deva Path को Rasengan से समाप्त करता है। Yahiko के उधार लिए शरीर से काले chakra रिसीवरों को उखाड़ने के बाद Naruto सच्चे Pain को ढूँढकर उससे बात करने का संकल्प लेता है और Katsuyu से दूसरों को पीछा न करने की चेतावनी देने को कहता है। वह स्लग Sakura, Hinata, Kō और Team Guy तक उसका संदेश पहुँचाती है, यह बताते हुए कि Six Paths पराजित हो चुके हैं और Naruto अंतिम Pain का अकेले सामना करना चाहता है। Neji और Guy मदद करना चाहते हैं, लेकिन वे उसकी अकेले जाने की इच्छा का सम्मान करते हैं।

रास्ते में Inoichi, Shikaku और Hyūga कबीले का एक सदस्य उसे देखता है। Inoichi चाहता है कि समूह Pain को खत्म करने में मदद करे और जब Naruto बताता है कि वह केवल बात करना चाहता है, मारना नहीं, तो वह नाराज होता है। Shikaku, Inoichi को शांत करता है और Naruto को जाने देता है, यह बताते हुए कि उसके बेटे Shikamaru ने एक बार Naruto की दूसरों को अपने पक्ष में खींचने की क्षमता का वर्णन किया था और भविष्यवाणी की थी कि वह Konoha के लिए बहुत महत्वपूर्ण होगा, प्रशंसा में इतने कंजूस व्यक्ति से आया यह निर्णय Shikaku को भी उस पर वही भरोसा रखने के लिए प्रेरित करता है।

Naruto, Sage Mode में प्रवेश करता है, असली Pain का सटीक पता लगाता है और एक विशाल पेड़ के भीतर बने ठिकाने में प्रवेश करके Nagato और Konan को ढूँढता है। Nagato उसे chakra रिसीवर से भेदता है, जानबूझकर महत्वपूर्ण अंगों को बचाते हुए क्योंकि उसे jinchūriki को जीवित चाहिए, लेकिन Naruto, Sage Mode बनाए रखते हुए Nine-Tails के chakra को छड़ के माध्यम से वापस भेज देता है, जिससे Nagato असहाय हो जाता है। क्या वह उससे नफरत करता है, यह पूछे जाने पर Naruto को याद आता है कि Nagato ने Jiraiya और Kakashi को मारा था और वह मारने के लिए झपटता है, तभी Konan अपने मित्र को बचाने के लिए आड़े आ जाती है। Jiraiya की घृणा के चक्र को समाप्त करने की आशा और उसके पिता की चेतावनी कि ऐसी व्यवस्था केवल Pain जैसे और लोगों को जन्म देती है, को याद करते हुए Naruto रुक जाता है, Nine-Tails की शक्ति और Sage Mode दोनों को छोड़ देता है और उनकी कहानी सुनने को कहता है, और Nagato इसे सुनाने के लिए सहमत हो जाता है।

Naruto, Deva Path को नष्ट करता है और सच्चे Pain का आमने-सामने सामना करने के लिए निकल पड़ता है। Shikaku, Shikamaru के उस पर विश्वास का हवाला देते हुए Inoichi को Naruto को अकेले जाने देने के लिए मनाता है। Naruto, Sage Mode का उपयोग करके Nagato और Konan का पता लगाता है, Nagato के chakra रिसीवर से बच जाता है और उसे निष्क्रिय कर देता है। Nagato को मारने के कगार पर Naruto संयम चुनता है और उसके तथा Konan के अतीत को सुनने के लिए कहता है, जिसे Nagato साझा करने के लिए सहमत हो जाता है।

यह एपिसोड Pain's Assault के दौरान मंगा के अध्याय 442 से 444 को रूपांतरित करता है और उसके बाद आने वाले Nagato के फ्लैशबैक की तैयारी करता है। यह प्रारंभिक थीम A World That Was Transparent और समापन थीम Transient Fireworks के साथ प्रसारित होता है। शीर्षक के दो शिष्य Naruto और Nagato हैं, दोनों Jiraiya के शिष्य जो घृणा के एक ही प्रश्न की ओर विपरीत मार्ग अपनाते हैं।