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アニメ放送中の1996年3月に発売された、初の『エヴァンゲリオン』ゲーム作品となるSega Saturn向けFMV（フルモーションビデオ）アドベンチャー。TVアニメ第8話「アスカ、来日」の直後を舞台とし、TV版キャストによるフルボイスのオリジナルストーリーと、ターン制の使徒戦を組み合わせている。

Neon Genesis Evangelionは、日本限定で発売された無関係な2つのゲームに共有されているタイトルである。1つはRPGとFMV（フルモーションビデオ）戦闘を備えた1996年のSega Saturn向けアドベンチャーゲーム、もう1つは1999年のNintendo 64向け3D対戦格闘ゲームである。両作ともオリジナルテレビシリーズの映像とボイスを使用して、アニメの使徒との戦いを再現している。

1997年にSegaから発売された、Sega Saturn用『新世紀エヴァンゲリオン』の続編で、映画『シト新生』の公開1週間前にリリースされた。前作のスロットマシン型戦闘システムを廃して3D戦闘を採用し、使徒のコアを秘めた謎の転校生を巡る選択肢分岐型のストーリーをより重視している。

デジタル対戦／トレーディングカード収集を軸としたSega Saturn向けファンディスク。プレイヤーは9種類のミニゲーム、クイズ、反射神経チャレンジをクリアすることで、劇中の動画クリップ、次回予告、イラスト、ミニコミックなどを収録したカードを解放していく。

Gainaxによる『エヴァンゲリオン』のビジュアルノベル。オリジナルキャラクターの霧島マナが登場し、彼女はエヴァに対抗する機体のパイロットでありながらシンジに惹かれていく。1997年にWindowsで初登場し、その後10年間にわたりSega Saturn、PlayStation、PlayStation 2、PSPへと移植された。

『エヴァンゲリオン』、『ふしぎの海のナディア』、『トップをねらえ！』のGainax3作品のキャラクターたちが願いを賭けたトーナメントでシンジと対戦する麻雀クロスオーバー作品。1998年にPlayStationおよびSega Saturn向けに発売され、翌年にはアダルト要素を追加したPC移植版へと拡張された。

『エヴァンゲリオン』の壁紙、スクリーンセーバー、音声クリップ、デスクトップ用プチユーティリティなどを収録した、WindowsおよびMacintosh向けCD-ROMのシリーズ。Gainaxは1996年から『鋼鉄のガールフレンド』の時代にかけて、作品（ボリューム）を連続してリリースした。

Shinji and Good Friendsは、1999年にGainaxから発売された6〜7本の安価なWindows向けミニゲーム群の総称であり、ストーリーを描くのではなく、ソリティア、花札、大富豪、ページワン、お絵かきパズル（ノノグラム）といった定番のカードやパズルの形式にEvangelionのキャラクターアートをあしらったものである。

加持リョウジとなって使徒の胎児を擬似的な1週間の中で育成し、全23種類の最終形態へと成長させて3機のエヴァンゲリオンと戦わせるWonderSwan用育成シミュレーションゲーム。1999年7月にBandaiから日本で発売された。

Gainaxによる『エヴァンゲリオン』のタイピングソフトで、1999年12月にWindows用として初登場し、後にDreamcastおよびPlayStation 2へと移植された。作中キャラクターの伊吹マヤがガイド役となり、アニメの代表的なシーンを再現した7つのタイピングレッスンをプレイヤーに案内する。

『新世紀エヴァンゲリオン タイピング補完計画』は、Gainaxが2000年に発売したWindows用タイピングソフト。キーボード練習をミサトがナビゲートする『エヴァンゲリオン』テーマのミニシナリオ仕立てにしており、2001年には専用キーボードを必要とするDreamcast版も登場した。

『新世紀エヴァンゲリオン 綾波育成計画』は、Gainaxが2001年に発売したWindows用育成シミュレーションゲーム。『プリンセスメーカー』のフォーマットをベースにしており、プレイヤーはNERVの保護者として綾波レイの勉強、仕事、娯楽などのスケジュールを約1年間にわたって管理し、多様な職業エンドや恋愛エンドを目指す。

Neon Genesis Evangelion 2は、広大なマップ上でエヴァを操作し、CGカットシーンで描かれるアクションコマンドバトルを通じて、碇シンジ、綾波レイ、アスカのストーリーアークを追体験および再解釈する、Alfa Systemによる2003年のPlayStation 2向けロールプレイングゲームである。

Shinji Ikari Raising Projectは、TVシリーズ第26話で描かれた平和なパラレルワールドを舞台に、プレイヤーがミサトとして3つの分岐ルートにわたってシンジの週間の行動スケジュールを管理する、Gainaxによる2004年のWindows向け育成シミュレーションおよびラブコメディゲームである。

Hisshou Pachinko-Pachislot Kouryaku Series Vol. 1: Evangelionは、BitsyおよびD3 Publisherによる2005年のPlayStation 2向け攻略シミュレーターであり、ストーリー内容は含まれず、プレイヤーが確率やリールパターンを練習できるように実機の『CR Neon Genesis Evangelion』パチンコ台を再現している。

Girlfriend of Steel 2ndは、TVシリーズ第26話で描かれた平和なパラレルワールドの第3新東京市を舞台に、2003年にWindowsおよびMac向けに初公開され、2005年にPlayStation 2へ移植されたGainaxのビジュアルノベル兼恋愛シミュレーションゲームである。

Bistyの実機筐体である『CR Neon Genesis Evangelion Second Impact』と『Pachislot Neon Genesis Evangelion』の2台を再現した日本限定のPlayStation 2向け攻略シミュレーターであり、プレイヤーは実機で金を賭ける前にリールパターンや出玉確率を研究することができる。

映画『The End of Evangelion』の出来事を舞台にしたPlayStation 2向けビジュアルノベルのスピンオフ作品であり、オリジナルのNERV職員・剣崎キョウヤが10種類の分岐エンディングを通じて人類補完計画とエヴァンゲリオン4号機の真相に迫る。

碇シンジをNERVの捜査官に仕立て直し、第3新東京市で発生する殺人犯を追うPlayStation 2向けミステリーアドベンチャー。ビジュアルノベル形式の聞き込みや証拠収集に時折3Dバトルパートを挟む構成で、TVアニメ版のオリジナルキャストがフルボイスで出演している。

完全に3D化されたアリーナでエヴァンゲリオン各機体と使徒をスマブラスタイルの対戦で戦わせる、6人のキャラクターのストーリーキャンペーンを備えたPS2向け対戦アクションゲームであり、2009年のPSP移植版では『ヱヴァンゲリヲン新劇場版』世界観のデザインでロスターが拡張された。

Bistyの実機パチンコ『CR新世紀エヴァンゲリオン 〜奇跡の価値は〜』を再現したPlayStation 2用パチンコ・パチスロ練習シミュレーター。自宅での研究用に実在の『エヴァンゲリオン』台を再現したD3 Publisherのソフトラインの一作。

Bistyの実機『CR新世紀エヴァンゲリオン〜まごころを、君に〜』を題材としたパチンコ／パチスロシミュレーターで、D3 Publisherから2007年後半にPS2向け、続いて2008年前半にNintendo DS向けに発売された。

ちびキャラコメディシリーズ『Petit Eva: Evangelion@School』からスピンオフしたNintendo DS向けミニゲーム集であり、学年暦に沿ってポイント・アンド・クリック、横スクロール、パズルセグメントを交えた48個のタッチスクリーンミニゲームを通じて碇シンジをプレイする。

Bistyのパチンコ実機『CR新世紀エヴァンゲリオン〜使徒、再び〜』をシミュレートした作品で、D3 Publisherより攻略シリーズの後半タイトルとして2008年中旬にPS2およびNintendo DS向けに発売された。

D3 Publisherが手掛ける長寿シリーズ「必勝パチンコ★パチスロ攻略シリーズ」のパチスロシミュレーター。実機のパチスロ『新世紀エヴァンゲリオン 〜約束の時〜』のリール動作やボーナスラウンドなどを、PlayStation 2やNintendo DSで自宅にいながら練習できる。

『ヱヴァンゲリヲン新劇場版』の第1作『ヱヴァンゲリヲン新劇場版：序』（『Evangelion 1.0 You Are (Not) Alone』）を題材としたBandai Namcoの3Dメカアクションゲームで、自由なカメラ操作による使徒との戦闘を通じてエヴァ機体を直接操作し、戦闘の合間にショップで強化を行っていく。

従来のゲームではなく日本国内限定のPlayStation Network向け月額課金サービスで、セルシェーディングによる3Dアニメーションの葛城ミサトが、PS3やリモートプレイ経由のPSP上で利用者に実社会のニュースを読み上げる。

D3 Publisherの攻略シリーズにおけるPlayStation 2向け第14弾で、パチンコ実機『CR新世紀エヴァンゲリオン〜最後のシ者〜』をシミュレートし、2009年中旬にPlayStation 2およびNintendo DS向けに発売された。

Fields Corporationから発売されたPlayStation 3専用のパチンコシミュレーターで、実機ホール台『CR新世紀エヴァンゲリオン 〜始まりの福音〜』を再現している。2010年後半に日本でリリースされた攻略用ディスクライン『激熱!! パチゲー魂』シリーズの一作である。

須田剛一率いるGrasshopper Manufactureが開発したPSP向けリズムアクションゲーム。山岡晃が手掛けた楽曲に合わせ、『ヱヴァンゲリヲン新劇場版：序』および『ヱヴァンゲリヲン新劇場版：破』の映像と音楽を背景にしたリズムステージを楽しめる。

『EVA Card Game』は、Media Magicが2012年に配信したAndroid用アプリ。『エヴァンゲリオン』のキャラクターやアートワークを取り入れたデジタルカードゲームシミュレーターであり、同年に日本のアプリストアに登場した複数のライセンス作品の一つである。

『EVAスライドパズル 使徒殲滅作戦』は、2012年にMedia Magicから配信されたAndroidおよびiOS用のパズルアプリで、使徒との戦いをスライドパズル形式にし、一致するブロックのラインを消すことでステージごとに襲来する使徒へEVAの攻撃を発動させる。

Evangelion MEMORIAは、TaitoがCOPROとともに開発した、Android、iOS、およびDeNAのMobageプラットフォーム向けの2012年のソーシャルガチャゲームであり、プレイヤーは碇シンジの学校の新パイロット候補生となり、ゲーム内のフレンドとともにメモリを集めて使徒と戦う。

EVA Arcade Seriesは、2012年12月からAndroidおよびiOS向けに展開された小規模なカジュアルスマートフォンゲームのラインナップであり、スライド式ジグソーパズル、コイン落としゲーム、タイルマッチング・パズルバトルゲームなど、別個のタイトルにわたって『ヱヴァンゲリヲン新劇場版』のアートワークを使用している。

『エヴァンゲリオン 魂のカタルシス』は、DeNAが2014年に配信したAndroidおよびiOS向けの戦略アプリ。プレイヤーは自身の第3新東京市を要塞化しつつ、使徒をクローン化して他プレイヤーの都市へ攻撃を仕掛けるという、『クラッシュ・オブ・クラン』のような基地建設スタイルのゲームシステムを採用している。

『ヱヴァンゲリヲン バトルミッション』は、Donuts Co.が開発し、KharaからのライセンスのもとBushiroadから配信された2014年のAndroidおよびiOS向けガチャゲームで、EVAやパイロットのカード収集と、同色ブロックを繋げて襲来する使徒に攻撃を加えるリアルタイムパズルバトルを組み合わせている。

『ゆるしと エンジェルドロップ』は、Media Magicが『エヴァンゲリオン』20周年を記念して2015年に配信したAndroidおよびiOS向けのマッチ3パズルRPG。ディフォルメされた可愛い使徒たちがパズルのターゲットとして登場し、クリアすると壁紙やアイテムなどの報酬が手に入る。

『エヴァンゲリオン バトルフィールズ』は、Kharaのライセンスのもと、LIONAとTakara Tomy Artsが2020年に配信したAndroidおよびiOS向けのリアルタイムPvPアクションゲーム。プレイヤーはエヴァに搭乗してオンラインで他プレイヤーと対戦し、エヴァ形状のBluetoothコントローラーやコレクション用IDチップ入りフィギュアといった物理玩具と連動する。