ホムンクルス

ホムンクルスの大部分は人間と見分けがつかない姿をしており、社会の中に紛れ込んで行動することができる。多くの個体に共通して黒髪、原作漫画では紫色の目、四肢に赤く浮かび上がるラインが見られるが、2009年のアニメ版では個体ごとに多様な目の色が与えられている。プライドを除く全員がウロボロスの紋章を宿しており、これは刺青ではなく誕生時にあざのように体表へ浮かび上がるものである。中には人間とは似ても似つかない真の姿を隠している者もいる。核となる賢者の石から供給される膨大なエネルギーにより、歳を取ることはなく、筋力、速度、敏捷性のすべてにおいて人間を遥かに凌駕する。最大の能力は再生であり、核である石の中に魂が残っている限り、どんな傷も数秒で塞ぎ、砕け散った身体さえも再構築する。出血し切断された部位は灰となって崩れ去る。しかし、賢者の石のエネルギーが尽きれば命を落とすため、真の意味で完全な不死というわけではない。

各々が象徴する単一の感情にとどまらず、ホムンクルスたちは生まれ持った圧倒的な力ゆえに自分たちをあらゆる生き物より優れていると捉えがちであり、人間に対して露骨な見下しを向ける者が多い。エンヴィーは最も執拗で悪意に満ちた憎しみを抱き、プライドは最高度の冷酷な蔑視を向ける。一方でグリードは人間を心から嫌悪しておらず、人生が得られるあらゆるものを欲するがゆえに人間の中に仲間を求める異色の存在である。2003年のアニメ版ではこの点がより深掘りされており、終盤において愛や悲しみ、絶望を感じ取れる複雑な存在として描かれ、人間に襲いかかりながらも人間になることを切望する姿が描かれている。

原作漫画および2009年版アニメにおいて、悪役たちの起源は「お父様」へと遡る。彼はかつてヴァン・ホーエンハイムとなる奴隷の血から生まれた「フラスコの中の小人」であった。完全な存在となることを求めたお父様は、人間を不完全たらしめていると考えた7つの欲望を自らの魂から切り離し、プライド、エンヴィー、グリード、スロウス、ラスト、グラトニー、ラースを生み出した。クセクセスの人口の半数を用いて自身を生きた賢者の石と化した彼は、その石の欠片を生きている体に注入することで新たな個体を生み出す術を得た。また別の方法として、人間の血液中に賢者の石を直接注入する手法もあり、大半の素体は死に至って石が回収されるが、耐え抜いた強靭な生存者はホムンクルスとなる。その後、政府は中央司令部の地下で魂を持たない「人形兵」を大量生産した。これらは群がって貪り喰らう思考を持たない白い異形である。

2003年版アニメでは設定が異なっている。そこでは、錬金術師が人体錬成を試みるたびにホムンクルスが誕生する。蘇らせようとした本人が戻ることはなく、死者の遺伝情報や記憶の断片を引き継いだ異形の生命体が生まれる。そして「赤い石」を摂取させることで、本来蘇らせるはずだった人物の姿へと変貌していく。これらの生命体は黒幕であるダンテに仕えており、ダンテは彼らを忠実につなぎ止めるために「人間にしてやる」という言葉で惑わしながら、賢者の石の錬成に向けて国家を裏で操る。彼らに共通する弱点は、元となった人間の遺骨や身体の残りであり、それが近くに存在すると身体が麻痺してしまう。