天の光はすべて星

アンチスパイラルはニアの反逆の根本を探り、彼女を螺旋族のゲノムに組み込まれた仮想生命体に過ぎず、メッセンジャーとして目覚めるためだけの存在だと吐き捨てる。彼女はシモンが必ず来ると断言し、ドリルが打ち破って彼女を解放すると同時に彼女の指輪が緑色に輝き、その背後にグレンラガンが現れる。シモンは自らの上着で彼女を包み、約束を果たした。さらに13本のドリルが全乗組員を連れ戻し、シモンは多元宇宙迷宮から脱出できる者などいないという敵の動揺を一蹴する。機体が機体を内包し、すべてのメンバーが銀河螺旋深淵から引き上げられたラガンに乗り込み、螺旋の星々の上に天元突破グレンラガンが姿を現す。アンチスパイラルは対等の条件で戦うべくグランゼボーマで応戦し、肉体を取り戻したロージェノムはニアに対し、父親として向き合う資格はないとしつつも、よくやったと称える。

巨神同士の決闘は波乱の幕開けとなる。ヨーコは超銀河サイズのライフルを召喚し敵の角の間の球体（アンチスパイラル本星）を撃ち抜くが、敵は全宇宙を守る決意の証として自らの肉体と母星を封印した経緯を語りながら、銀河そのものを手裏剣のように投げつけてくる。ライフルは切り裂かれ、ヴィラルの双剣は砕け散り、グランゼボーマは天元突破グレンラガンを銀河から銀河へと叩きのめす。その激突は地球への時空バイパスを切り開き、逆方向からの支援が届く。ダヤッカは次元アンカーと「宇宙一の女房に捧げるスイング」で敵を捕らえ、アテンボローの確率変動弾が防御の選択肢を打ち消す。シモンは、自分たちが戦って手に入れる明日は無限の宇宙から自ら選んだものであり、スパイラル・ネメシスは自分たちの手で阻止すると宣言する。激怒したアンチスパイラルは2つの銀河を衝突させて天地創造規模のエネルギー「インフィニティ・ビッグバン・ストーム」を発動する。巨神の口からラゼンガンが飛び出し、ロージェノムはニアに涙を拭うよう告げると、量子分解によってその攻撃を吸収し、その全てをシモンのための絶大なドリルへと変換する。

その贈り物を得た一行は、ついに再生するグランゼボーマに手傷を負わせる。シモンは自分たちの力を「一分一秒ごとに進化する力」と呼び、敵の語る限界論を突き返す。閉ざされた宇宙に閉じこもり他者を檻に入れる種族こそ、自らの限界に直面しているに過ぎないと。最後の突撃はリレー形式となり、敵が抑え込むたびに各機体がより大きな機体の口から飛び出し、ついにヴィラルが素のラガンを母星へと打ち出す。触手がラガンの四肢を削ぎ落とし、シモンのメガネが砕け散るが、ラガンインパクトがアンチスパイラルを貫く。消えゆく敵の最後の言葉は「宇宙を守れ」という頼みであり、シモンは「人類はそこまで愚かじゃない」と応える。

亜空間が崩壊し、艦隊は帰還を果たし、解放された螺旋族から歓喜のメッセージが届く。一週間後、ロシウの司式のもとシモンとニアの結婚式が執り行われるが、誓いのキスの直後に彼女は消滅し始める。アンチスパイラルが倒されたことで、彼女を維持する存在がなくなったからだ。二人は最後の愛を交わし、彼女の指輪だけが残される。シモンは、去った者が次の世代の邪魔になると主張して螺旋力で死者を蘇らせることを拒み、ギミーにコアドリルを託し、政治をロシウに任せ、指輪を胸にただの穴掘りシモンとして地平線へと去っていく。

20年後、大統領となったロシウと年老いたリーロンが第1回銀河螺旋平和会議の準備を進めている。再びヨマコと名乗るヨーコは島の学校の校長を務め、かつての教え子ナキムはグラパール隊とともに大空を駆ける。ギミーとダリーがグレンラガンを操縦し、ヴィラルが地球の使節として超銀河ダイグレンを指揮し、カミナの墓の傍らには戦死者のための7本の剣と、花に飾られた十字架にニアの指輪が捧げられている。その夜の砂浜で、老いた放浪者が少年に優しくドリルの使い方を教え、自分が誰かという問いを受け流す。艦隊が空へと飛び立つ中、ブータが老人の肩に乗り、年老いたシモンは頭上の光を「螺旋の仲間たちが待つ星々」と呼ぶ。

天元突破グレンラガンが誕生し同戦闘内で失われ、グランゼボーマが唯一の登場を果たし、アンチスパイラルがラガンインパクトによって倒される。ロージェノムはインフィニティ・ビッグバン・ストームを螺旋力へと変換し、二度目にして最後の自己犠牲を払う。

シモンとニアが結婚するが、その直後にニアは存在を維持できず消滅する。シモンはギミーにコアドリルを託して姿を消し、エピローグでは20年後の地球が全銀河の螺旋族と交流し、スパイラル・ネメシスの回避に努める姿が描かれる。

日本語タイトルの『天の光はすべて星』は、英語放送タイトルのThe Lights in the Sky are Starsに対応している。日本では2007年9月30日に最終話が放送され、英語版は2008年11月10日に放送された。第26話に続く話であり、本シリーズの完結編となる。

ガイナックスは制作予算がほぼ尽きた状態で全27話で完結させ、スタッフも単純なハッピーエンドは成立しないと考えていた。天元突破グレンラガンはスーパーロボットジャンルにおける最大サイズ記録を樹立し、後に同スタジオ自身が超天元突破へのパワーアップによってその記録を更新した。前話までとは異なり、アイキャッチでは恒例の「Row Row Fight the Power」の楽曲が使われず、エピローグではシモンが全話の語り部であったことが明かされ、劇場版第2作ではシモンがニアの指輪を持ち続けるなど大幅な変更を加えてこの結末が再構築されている。