忍者編

物語のこの区切りは全体で第19編、ネオヒーローズ編の中で第4章に位置する。フラッシュによる執拗な勧誘の試み、彼と音速のソニックを育んだ忍者の里の埋もれた過去、そしてヒーロー協会へのブラストの電撃的な帰還という3つの糸が交錯する。個人的な手合わせの賭けは、やがて神の従者たちとの激突へと発展していく。

自分の指導のもとであればサイタマが未知の領域へ到達できると確信した閃光のフラッシュは、サイタマがキングとゲームをしているアパートへ何度も姿を現す。彼はついに条件を取り付ける。フラッシュ自身の用意した場での勝負で、負ければサイタマは弟子となり、30分以内に一撃でも打ち込めば自由を得られるというものだった。サイタマはすべての攻撃を受け流し、一撃を打ち込もうと迫るが、怪人発生の報を持ってきたジェノスによって勝負は中断される。

別の場所では、ヘビータンクボング、ボーン、ピーチテリーがインターネットサーファーズに押されている中、見物するソニックの姿が目撃される。サイタマ、ジェノス、フラッシュが到着し、さらにウインドとフレイムが追いついたことで緊張感のある四つ巴の対峙が生まれる。結末は一瞬だった。サーファーズはあっという間に倒され、サイタマはソニックをコンクリートに突き刺し、フラッシュは2人の属性格闘家を退却へと追い込む。

ライバルや弟子といった茶番に関わりたくないサイタマは、マナコを自ら追跡し、キングのために彼女の似顔絵を描いて彼の協力を得て捕獲する。一行はシッチと連絡を取りブラストを呼び出そうと決意するが、協会本部にすでにブラストが待機しているのを発見する。彼はフラッシュを育んだ忍者の里と「神」との繋がりを明かし、「あのお方」としか呼ばれないその首領が目覚めたと警告する。

ウインドとフレイムに追い詰められたソニックの前に、天忍党の全メンバーが現れる。里の卒業生である彼らは、里の崩壊によって仲間を作ることへの掟が緩んだと説明し、フラッシュを殺し、ブラストを排除し、世界を掌握するという野望を明かす。彼らはソニックに対し、指定した場所にフラッシュを誘い出すよう命じる。一方フラッシュは、卒業の日にソニック以外の里の者を全員殺害したことを告白し、ソニックからの挑戦状に応じる。

かつての友人同士は天忍党が乱入してソニックを裏切り者と決めるまで決闘を繰り広げる。ポチの嗅覚に導かれ、ブラストが現場に到着し、一人も殺すことなく天忍党全員を叩きのめす。その後、彼は一行をソニックのアジトへとテレポートさせると、そこには人型のクレーターの横にサイタマが座っていた。それは画面外であっけなく倒された里の首領・ヴォイドだった。空に亀裂が入ると、神の守護者である2頭の神獣、白虎と玄武が時空の歪みから飛び出してくる。

獣たちが街区全体を破壊する中、ブラストが防御バリアを展開する。ポチを抱えたサイタマは攻撃しようと跳び上がるが、目を覚ましたヴォイドによって遮られる。ヴォイドとブラストは力を合わせて守護者たちを退けて元の場所へと送り返し、ヴォイドの怪人の顔が割れて神の支配から解放された人間としての素顔が現れる。ブラストはサイタマにこれから訪れる戦いへの協力を求め、ヴォイドと共に時空の歪みへのポータルを通って立ち去るが、そこで白虎、玄武、そして3頭目の神獣・麒麟の死体を発見し、それが明らかにサイタマの仕業であることを知る。

エンプティ・ヴォイドは神の汚染を脱ぎ捨て、ブラストの味方として復帰する。ソニックと天忍党は初めて「神」と謎のキューブの存在を知り、それがソニックにフラッシュと共に訓練を再開させる動機となる。ブラストの任地である時空の歪みが明らかになり、彼は神獣を含む神の創造物が地球へ到達するのを防ぐためにそこを監視していたのだった。サイタマが神の手先から力を奪うのを目撃したブラストは、来るべき最終決戦への協力を正式に要請する。その後の数日間、天忍党は宗教的な情熱をもってサイタマを追いまわし、自分たちを率いるよう付きまとうのだった。