『ワンパンマン』第3話では、「進化の家」編が完結する。サイタマとジェノスはジーナス博士の隠された研究所に乗り込み、追い詰められた博士は檻に閉じ込められていた切り札、阿修羅カブトを解き放つ。サイタマとの戦いは決まりきった結末を迎え、ジーナス博士は自らの研究人生を見つめ直すことになる。
エピソードの冒頭では、かつて自らの手で人類の進化を導くことを夢見た天才研究者、ジーナス博士の栄枯盛衰がナレーションで語られる。不完全だと判断した世界に失望した彼は、不老不死の謎を解き明かし、研究所を自身の複製で満たしたのだった。
退屈な説明に耐えかねたサイタマが割り込むと、アーマードガリラは博士が研究のためにサイタマの肉体を狙っているのだと説明する。サイタマは当初その関心を恋愛感情だと勘違いするが、ジェノスから実験材料として狙われているのだと説明される。スーパーの特売日が迫る中、二人は早急に決着をつけることを決意する。ジェノスは4年前に街を破壊したサイボーグについて質問を挟むが、アーマードガリラは何も知らないと主張する。
サイタマを迎え撃つべく、「進化の家」は館内にトラップを仕掛け、渋々ながらも最高傑作である阿修羅カブトを解放する。ジェノスは一撃のエネルギー波で地上施設を吹き飛ばし、地下へと降りるが、阿修羅カブトはかすり傷一つ負わずに彼と拳を交える。
サイタマが前に出ると、その圧倒的な強さを察知した阿修羅カブトは恐怖で身をすくませる。サイタマは自分の強さの秘訣を、腕立て伏せ100回、上体起こし100回、スクワット100回、そして10キロ走を毎日欠かさず行うという地道なトレーニングだとあっけらかんと語るが、ジェノスはその言葉を受け入れようとしない。阿修羅カブトは阿修羅モードへと変身し、一時は圧倒しているように見えたが、サイタマはただ特売日が明日ではなく今日だったことに気づいて動揺していただけだった。サイタマの一撃によって怪人は倒され、二人のヒーローは特売に間に合わせるために立ち去る。その一部始終を見ていたジーナス博士は、人工的な進化の追求を捨て、真に変革が必要なのは自分自身なのだと結論付ける。
アニメ版のアダプテーションでは、原作漫画で描かれなかった詳細が補完されている。アニメでは施設に仕掛けられたテーマ別のトラップフロアにそれぞれ名称が付けられており、迷路、水、火、吹雪、電気の部屋から、針、真空、重力室へと続いている。ジェノスの攻撃シーンも再構成されており、連続攻撃の前に火炎を吹きつけながら阿修羅カブトの周囲を蹴りで旋回するほか、怪人は跳躍するのではなく甲虫の羽で後退する。ラストのジェノスとジーナス博士の会話や、クレーターを調査に訪れてジェノスの火力に驚愕するヒーロー協会の調査隊など、アニメオリジナルの展開もいくつか追加されている。
Cパートのモノローグは阿修羅カブトが担当している。また、作画の整合性におけるユニークな点として、部屋が地下にあるにもかかわらず、サイタマが開けた穴から夕日が見えている。これは、特売が夜10時までで残り約4時間であるというジェノスの以前の発言と整合性を保つための演出である。
第3話では、サイタマとジェノスがジーナス博士の秘密研究所に潜入し、博士が最高傑作である阿修羅カブトを解き放つものの、最後はサイタマのいつものパンチ一発で決着がつき、進化の家編が完結する。
「執念の科学者」において、ジーナス博士は人類の進化を制御することに執着する研究者であり、実験材料としてジェノスのサイボーグ身体を研究しようとするが、その要求はジェノスとサイタマに拒絶される。
阿修羅カブトはジーナス博士が幽閉していた切り札の怪人であり、ジェノスやサイタマと戦うために解放されました。より強力な阿修羅モードに変化することができますが、サイタマにワンパンで撃破されます。
サイタマはその圧倒的な強さの理由を、腕立て伏せ100回、上体起こし100回、スクワット100回、ランニング10kmという毎日のシンプルな日課のおかげだと説明しますが、見せつけられた絶大なパワーを前に、ジェノスはその主張を信じようとしませんでした。
サイタマの圧倒的な力を目の当たりにしたジーナス博士は、人工進化の追求を諦め、本当に変わらなければならないのは世界ではなく自分自身であると結論付けます。
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