最後のウィッチが襲いかかり、ちびうさが連れ去られる中、デス・バスターズは最終罠を発動させる。ほたるから生まれた存在はセーラーサターンではなく、遥かに危険なミストレス9であることが判明するのだった。
最後のウィッチ・シプリンは夜陰に紛れて群衆を無限学園へと誘導し、彼らの「純粋な心の結晶」を一気に吸い上げる。内部戦士たちが彼女に立ち向かうと、彼女は戦士たちを自室へテレポートさせ、既に正体を知っていることを明かす。戦いの途中で赤い閃光が割り込み、シプリンの双子の妹プチロルが現れ、二人は驚異的な連携で一つのウィッチとして立ちはだかる。彼女たちは戦士たちを異空間に閉じ込め、あらゆる攻撃を杖に吸収して自らの糧としていく。
臨機応変に対応したマーキュリーが「シャボン・スプレー」で戦場を覆い、ジュピターとマーズが双子を引き離すことで、彼女たちの相撃ちを誘って自滅させ、奪われた結晶を解放する。別の場所では、カオリナイトがちびうさをほたるの家に誘い出し、セーラープルートとタキシード仮面の制止を振り切って連れ去る。
無限学園の奥深くで再集結した戦士たちは、捕らわれたちびうさと、「沈黙のメシア」に憑依されたほたるを発見する。部屋はカオリナイトと土萌教授の主導による暗黒の儀式の準備が整えられていた。セーラームーンの接近を拒むバリアが張られる中、メシアはちびうさの「純粋な心の結晶」を引き抜いて貪り食う。うさぎは土萌教授に娘を止めるよう泣き叫ぶが、教授にはもはや愛という概念すら理解できない。ほたるはセーラーサターンになるどころか、恐ろしいミストレス9へと変貌し、用済みとなったカオリナイトを即座に抹殺する。
校舎が崩壊する中、戦士たちはちびうさを連れて脱出する。結晶を失った少女の命を繋ぎ止めるため、衛は自らの身体を彼女の身体と同調させる。せつなは内部チームに対し、自分はウラヌスやネプチューンとともにミストレス9を抹殺すると告げる。他の戦士たちはほたるの身を案じるが、せつなはちびうさの心を取り戻すにはそれ以外に道はないと主張する。5人は必要であればほたるの命を絶つ覚悟を固め、無限学園へと向かうのだった。
本エピソードではシプリン、プチロル、そしてミストレス9が初登場し、カオリナイトの2度目にして最後の敗北が描かれる。原作漫画とはいくつか異なる点があり、漫画でのシプリンとプチロルは洗脳や降氷などの能力を操り、相撃ちではなくスーパーセーラームーンによって倒され、カオリナイトは恐ろしいダイモンに変異した末に最期を迎えた。また原作では、ミストレス9はちびうさの魂とともに彼女の銀水晶も奪い取っている。
土萌ほたるはセーラーサターンに変身するのではなく、沈黙のメシアがちびうさの純粋な心の結晶を奪い取って喰らった後、恐ろしいミストレス9へと変貌を遂げます。
セーラーマーキュリーがシャボン・スプレーで戦場を霧で覆い、ジュピターとマーズが双子の魔女シプリンとプチロルを引き離すことで、互いの攻撃同士を激突させて相打ちに追い込み、両者を消滅させて奪われたピュアな心の結晶を解放した。
利用価値がなくなったカオリナイトは、このエピソードでミストレス9によって消滅させられ、2度目にして最後となる敗北を迎える。
崩壊する無限学園からセーラー戦士たちが脱出する際、地場衛は結晶を失ったちびうさの生命を維持するため、自らの体と彼女の体を繋ぎ合わせた。
せつなは内部戦士たちに対し、たとえほたるの命を奪うことになろうとも、ちびうさの心を取り戻すには他に方法がないと主張し、ウラヌスやネプチューンとともにミストレス9を抹殺する決意を告げます。
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