Serangan Pain

Arc Part II ini, berjudul Two Saviours di anime, berpusat pada serangan Pain terhadap Konohagakure dalam pencarian Naruto Uzumaki. Di manga arc ini membentang sepanjang empat volume, berjalan dari bab 413 hingga 453, setelah Fated Battle Between Brothers dan sebelum Five Kage Summit. Versi anime mengisi episode 152 hingga 169 ditambah 172 hingga 175 dari Naruto: Shippuden, dengan sepasang episode mandiri disisipkan di antaranya, dan di sana arc ini dibingkai oleh Six-Tails Unleashed dan Past Arc.

Arc dibuka dengan tim Sasuke menundukkan Killer B, wadah Ekor Delapan, dengan kerugian besar sebelum menyerahkannya kepada Tobi, meskipun B diam-diam bertahan hidup dengan meninggalkan tentakel. Di Konoha, Pain menyebarkan keenam tubuhnya ke seluruh desa sehingga para pembelanya tidak dapat mengunci satu penyerang, sementara rekannya Konan menginterogasi shinobi yang menolak mengkhianati lokasi Naruto. Setelah mengetahui bahwa anak itu berlatih di Gunung Myoboku, Deva Path melepaskan ledakan gravitasi kolosal yang meratakan pemukiman.

Dipanggil balik ke rumah bersama Fukasaku dan para katak raksasa, Naruto tiba dengan menguasai senjutsu dan Rasenshuriken yang sempurna, dan menghancurkan lima dari Six Paths satu per satu. Ketika Hinata melemparkan dirinya di antara dia dan Pain dan dirobohkan, kesedihan mendorong Naruto ke dalam perubahan tak terkendali yang membengkak menuju delapan ekor, hanya untuk roh ayahnya Minato memperbaiki segel dari dalam pikirannya. Terbebas dari cengkeraman rubah, Naruto memancing tubuh terakhir ke dalam pulsa gravitasi yang merugikan diri sendiri dan mendaratkan pukulan akhir, lalu mengikuti penerima hitam menuju Nagato sendiri.

Daripada membunuhnya, Naruto mendengarkan sejarah Nagato: menjadi yatim karena perang, membangkitkan Rinnegan, dan kehilangan temannya Yahiko akibat skema Hanzo dan Danzo, yang mengubah mimpinya tentang perdamaian menjadi kekuasaan melalui ketakutan. Membacakan dengan lantang dari buku Jiraiya, Naruto bersumpah untuk memutus siklus itu tanpa balas dendam. Tergerak, Nagato mengorbankan hidupnya untuk teknik Outer Path guna menghidupkan kembali semua orang yang terbunuh dalam serangan itu, lalu meninggal, dan Konan meninggalkan Akatsuki sambil membawa jasadnya dan Yahiko.

Digendong kembali ke reruntuhan di atas bahu Kakashi, Naruto disambut di tepi desa oleh kerumunan yang bersorak, dan bahkan mereka yang pernah mencapnya sebagai ancaman kini memujanya sebagai pahlawan, memenuhi keinginan seumur hidupnya akan pengakuan. Tsunade, yang telah menguras chakranya untuk melindungi penduduk desa, jatuh ke dalam koma.

Dalam kekosongan kekuasaan, Danzo membujuk Daimyō Api untuk menunjuknya sebagai Hokage Keenam sementara, dan ia segera mencap Sasuke sebagai ninja pembelot yang ditandai untuk dibunuh. Di tempat lain Tobi mencegat tim Sasuke, menugaskan mereka kembali untuk membunuh Danzo pada pertemuan puncak yang akan datang, dan memutuskan untuk keluar dari bayang-bayang untuk memulai Eye of the Moon Plan miliknya.