Kemunculan Ekor Tiga

Eksklusif untuk anime Naruto: Shippūden, arc ini berlangsung selama episode 89 hingga 112 dan menjadi rentang khusus anime terpanjang dalam seri ini. Arc ini mengikuti upaya bersaing dari Akatsuki, Konoha, dan Tim Guren untuk menangkap Ekor Tiga. Arc ini hadir setelah Misi Penumpasan Akatsuki dan mengarah ke Misi Pengejaran Itachi.

Atas perintah Orochimaru, Kabuto dan Tim Guren membawa seorang bocah, Yūkimaru, ke sebuah danau dan memaksanya mencurahkan chakranya, memancing Ekor Tiga ke permukaan. Guren membantu menyeret makhluk itu sepenuhnya ke pandangan, tetapi upaya mereka untuk menundukkannya gagal ketika monster itu menyapu para penyerangnya dengan gelombang besar. Setelah melacak tempat persembunyian, Tsunade mengirim Kakashi untuk memimpin Tim 8, kemudian menyusul bersama Yamato, Sai, Sakura, dan Naruto. Pasukan Konoha menyadari targetnya adalah monster berekor itu sendiri dan mengumpulkan kelompok pemburu yang lebih besar.

Para ninja yang berkumpul terbagi menjadi tiga kelompok: satu untuk menyegel makhluk itu ke dimensi terpisah, satu untuk menjaga, dan satu untuk bertarung. Penyegelan hampir berhasil hingga gangguan Guren memprovokasi Ekor Tiga untuk menyerang semua orang. Yūkimaru sempat menenangkannya, tetapi begitu tenaganya habis monster itu berbalik menyerangnya; Guren dan Naruto melindunginya dan tertelan, lolos hanya dengan bantuan rekan-rekan mereka. Upaya penyegelan kedua kemudian dilakukan.

Tepat ketika upaya kedua itu hampir selesai, Yūkimaru yang dilanda duka, mengira Guren telah mati, memberi kekuatan pada monster itu untuk meledak bebas. Ia mengamuk, menghancurkan beberapa bawahan Guren, namun serangannya tidak pernah melukai bocah itu. Hanya teknik api angin dan minyak yang akhirnya mengusirnya. Shinobi Konoha yang tersisa menyerahkan penyegelan kepada Anbu dan pulang, tanpa menyadari bahwa Deidara dan Tobi dari Akatsuki segera memusnahkan Anbu tersebut.

Dalam manga penangkapan monster itu terjadi jauh lebih awal, pada pembukaan Misi Penumpasan Akatsuki, meskipun berlangsung dengan cara yang hampir sama: Tobi memancing Ekor Tiga sementara Deidara membentuk ikan dari tanah liat peledak untuk menjatuhkannya, setelah itu ia disegel di dalam patung kelompok tersebut. Arc ini juga meninggalkan jejak yang bertahan lama, karena Isobu kemudian mengenang pertemuan ini dengan Naruto ketika keduanya bertemu kembali selama Perang Dunia Shinobi Keempat.