碇ユイ

ユイの姿が直接描かれる機会は稀である。作中で彼女の人間としての姿が示されるのはほぼ回想シーンに限られ、主に大学時代や接触実験の当日の朝である。2004年以降はその肉体が存在せず、魂がエヴァのコアに引き込まれた際にLCLへと還元されたためである。

それ以降、初号機自体が彼女の目に見える存在となる。『THE END OF EVANGELION』ではその一体化を具現化し、彼女の髪を生やしたエヴァが宇宙へと漂流していく様子を描き、機械の中に宿る女性の永遠のイメージを残している。

ユイを知る人々は彼女の温もりを記憶している。人間としての彼女は優しく、楽観的で、揺るぎない母性を備えた人物として表現されるが、作中で最も強調されるのは、人類は生き残り記憶されるに値するという彼女の強い信念である。彼女はゲンドウに対し、生きようとする意志さえあればどこでも天国になり、生きているだけで幸せになれると語る。この信念は、息子のシンジが最終的に補完計画を拒絶し、肉体を持った生を選択する際に受け継がれる。

また彼女は他人が見落とす面も見抜いており、ゲンドウを誰も理解していない本当はとても純粋で優しい人だと主張する。しかし、その温かさゆえに彼女が底まで見通せる存在であったわけではない。ユイはゼーレの計画とも夫の計画とも異なる独自の目的を追求しており、その一部は夫にさえ秘密にしていた。ゲンドウが愛ゆえに彼女に近づいたのか、それともゼーレとの繋がりのためだったのかは意図的に曖昧にされており、同じ疑問は彼女自身にも問い返すことができる。

京都大学でユイは生体工学を専攻し、自身の専門とは異なる形而上生物学を研究していた冬月コウゾウと親しくなる。彼女は恩師である冬月を友人および相談相手として接した。ゼーレの有力者の娘であった彼女は、噂の絶えない年上の男性・六分儀ゲンドウと関係を深めて結婚し、彼が碇の姓を名乗るのを見届ける。ゲンドウが葛城調査隊の監査から帰還した後、2人の間に息子シンジが誕生する。もし娘であればレイと名付けられる予定であった。

ユイは箱根にある人工進化研究所（ゼーレの秘密組織ゲヒィルンの表向きの顔）で勤務し、E計画にその才能を発揮する。2004年、彼女は未完成の初号機との接触実験の被験者として志願し、明るい未来を見せるために4歳のシンジを連れて立ち会わせる。しかし実験により彼女の魂はエヴァのコアへと取り込まれ、肉体はLCLへと還元される。彼女を復元しようとしたゲンドウのリサルベージ手術は失敗し、最初の綾波レイが誕生することになる。

初号機の内部から、彼女は物語を通じて息子を見守り続ける。シンジが生命の危険に晒されるたび、彼女の魂はNERVの拘束を抑え込んでエヴァを暴走させる。第1話で落下するガレキからシンジを庇い、活動停止後にサキエルを撃破し、レリエル内部から脱出し、ゼルエルを解体してそのS²機関を摂取した。サードインパクトの際、レイ（3人目）がゲンドウを拒絶すると、人類の決断はシンジ、そして最終的にユイへと委ねられる。シンジが補完計画を拒否すると、彼女はロンギヌスの槍を携えて宇宙へ旅立ち、人類が存在した永遠の証として初号機を永久に漂流させる。

スピンオフ作品では彼女の運命が様々に再構成されている。『碇シンジ育成計画』では生存しており、家庭内で夫よりも強い立場を持つ喜劇的な存在として描かれる。『学園脱天録』では当初研究事故で死亡したと報告されるが、実際は現実を安定させるユグドラシルの木に取り込まれていたことが判明する。ゲンドウがシンジを木に捧げるのを阻止するためにゲンドウを殺害し、自らも命を落とした後、自己犠牲を払う渚カヲルにその役割が引き継がれる。日本語版の声優は林原めぐみが務め、英語版ではTVシリーズをキム・セヴィア、劇場版をアマンダ・ウィン＝リーが担当している。