イシュヴァール内乱

本格的な戦争が始まる遥か以前から、東方砂漠に接するアメストリス南東部の国境地帯に併合されていたイシュヴァール民は、中央政府に対して度々反発していた。宗教的・文化的対立を抱えながらも危うい平穏が保たれていたが、1901年にひとりの兵士がイシュヴァールの子供を射殺したことで状況が一変する。痛ましい事故に見えたその事件は、兵士の姿に化けたホムンクルスのエンヴィーによる計画的な挑発であった。怒りが地域全体を包み、暴動は本格的な反乱へと発展し、戦闘はアメストリス東部全域を戦場に変えるまでに拡大した。

アメストリス軍が圧倒的な兵力差を誇っていたものの、イシュヴァール民は屈しなかった。自国の利益のためにアメストリス南部国境の弱体化を狙う隣国アエルゴから武器が密輸され続けたことで反乱軍には物資が供給され、ゲリラ戦の妙によって戦争は泥沼の膠着状態へと陥った。7年が経過した1908年、キング・ブラッドレイ総統は国家錬金術師を人間兵器として戦線投入する「3066号特別厳命」を発令した。この転換は惨酷かつ決定的なものであり、残された抵抗を壊滅させると同時に、大虐殺を実行した錬金術師たち自身にも消えぬ悪名を刻むこととなった。

占領によってイシュヴァールの民はほぼ根絶やしにされ、生存者は故郷を追われてスラム街や国境の廃墟へと逃れた。アメストリス側も無傷では済まなかった。スカーに討ち取られた兵士たちをはじめとする多くの部隊が全滅し、敵味方を問わず傷病者を治療したユーリとサラのロックベル夫妻も命を落とした。エルリック兄弟の故郷であるリゼンブールも爆撃を受け、その発展は永遠に阻まれることとなった。

しかし、最も深い傷跡は精神に残された。多くの錬金術師が終戦後に資格を返上した。ティム・マルコーは犠牲になった命に胸を痛めて賢者の石の研究成果と共に逃亡し、アレックス・ルイ・アームストロングは奪った無辜の命の重さに精神を苛まれ、アイザック・マクドゥーガルは自らの罪に狂気して後に国家に反旗を翻した。ロイ・マスタングとリザ・ホークアイもまた深い罪悪感を背負い続けた。何の罪悪感も抱かなかった数少ない者たち（フェスラー、バスク・グラン、ゾルフ・J・キンブリー、ジョリオ・コマンチなど）は、それぞれ自らの破滅を迎えた。残酷な皮肉にも、切断手術を受けた傷病兵が殺到したことでオートメイル産業は大好況を迎えることとなった。

真の恐怖が表面化するのはずっと後になってからである。アメストリスの過去のすべての紛争と同様に、この戦争もまた全土錬成陣に必要な血を流すために仕組まれたものであった。イシュヴァールは大錬成陣の最後から2番目のポイント（北部のブリッグズが最後）であり、砲声が止んでから約8年後に錬成陣が発動されることとなった。