皆さん、ごきげんよう

空母戦から1ヶ月後、シモンとヨーコはカミナの墓を訪れる。彼が命を落とした火山地帯の崖の上に野太刀が突き立てられ、刀身には父親の外套が巻きつけられている。シモンはアニキのようにはなれないが、穴掘りシモンにしかできないことがあると告げ、すべてが終わったら必ず戻ってくると誓う。ダイグレンの艦内では、新しく装着された飛翔用スパイラルエンジンの修理をクルーが急いでいる。

テッペリンでは、ロージェノムが6日目の人類創造に関する教義を口にし、グアムはその意図を汲み取る。人間たちの猛攻6日目こそが、奴らを粉砕する日なのだと。シトマンドラがダイガンテンを率いて出撃する一方、螺旋王は人類自身の保護のために地下へ追いやったのだと述懐し、真の脅威を知らないからこそ戦い続けられるのだと、彼らの抗いを哀れむ。

戦闘は、ダイグレンがミサイルの集中砲火を間一髪で回避して浮上することで始まる。ガンメン部隊は新たな飛行装備で出撃し、キタンは自機と妹たちの機体を合体させて爆撃機群へ突撃する。そこへ地上から要塞ダイガンド率いるグアムの陸上部隊が到着し、シモンは戦力を二分する。他の全機がグアムを迎え撃つ間、グレンラガンは単機で空軍に対峙する。小型ドリルの嵐がシトマンドラの最前線をズタズタにし、空母からの巨大ミサイルが飛来すると、ロシウは一方を反転させて他方を迎撃・破壊する。専用機シュザックのみとなったシトマンドラは、4機の兵士にグレンラガンの四肢を押さえつけさせ、とどめを刺そうと接近する。彼の空軍部隊はダイグレンの砲撃を阻む肉の壁を形成する。

東からの砲撃が膠着状態を打ち破る。大グレン団の旗を掲げたガンメンの大艦隊が現れたのだ。リーダーのバチョウは、グアムに対するシモンの勝利が世界中で目撃され、各地の人々がガンメンを奪って立ち上がるきっかけとなったと説明する。援軍はシトマンドラの部隊を全滅させ、ダイグレン自身がシュザックを突き破ってダイガンテンへと突撃し、墜落する艦内で将軍を焼滅させる。炎上する空母はグアムの旗艦に激突するが、無傷で姿を現したダイガンドは、戦うこと以上に恐ろしい行動に出る。テッペリンの地下へと潜り込んで回転し、王都をエネルギーの竜巻で包み込んで接近する者を全滅させる。通信が切断され、バリアによって仲間たちが倒れていく中、投影されたニアの映像が突撃を制し、シモンのドリルは天を突くドリルだと宣言する。

シモンはすでに地下に潜り込んでいた。グレンラガンがダイガンドの真下に浮上して持ち上げる。グアムは逆噴射を点火して要塞を叩きつけるが、その衝撃によってドリルの先端が船体を貫通する。要塞自体の回転を逆転させ、シモンはダイガンドとグアム自身を貫く。グアムは自らの王に対し、忠実なる僕（しもべ）は今なお回り続けていると確信しながら命を落とす。要塞とともにエネルギーの壁が崩壊し、一行が最後の進撃の準備を整える中、テッペリンの塔群が崩落してその下に巨大な顔が姿を現すのだった。

カミナの墓標が初めて登場する。

シトマンドラとグアムの双方が死亡し、シュザック、ダイガンテン、ダイガンドが破壊される。

以前のシモンの勝利に鼓舞された世界中の人類の救援が、テッペリン攻防戦に参戦する。

テッペリンの正体が超巨大ガンメン「デカブツ」であることが明かされ、ダイグレンは手に入れた飛翔用スパイラルエンジンにより飛行能力を得る。

ロージェノムが引用する教義は、人間が6日目に創造されたという聖書の創世記の記述そのものである。

グレンラガンの全方位ミサイル攻撃は、『伝説巨神イデオン』第14話の有名なイデオンイタノサーカスへのオマージュである。

バチョウは学ランと口にくわえた藁という、番長という不良リーダーの原型に基づいて構築されており、その名前は「バンチョウ」のアナグラムになっている。