चौथा शिनोबी विश्व युद्ध: उलटी गिनती

खंड 52 से 55 में अध्याय 484 से 515 तक फैला यह खंड Naruto: Shippuden के एपिसोड 215 से 222 और बाद में 243 से 256 में रूपांतरित है, बीच में एक फिलर यात्रा रखी गई है। इसका विषय Fourth Shinobi World War तक की तैयारी है जब सभी युद्धरत पक्ष स्वयं को तैयार करते हैं। Five Kage Summit के बाद और Confrontation से पहले आते हुए, यह क्लोन सैनिकों और पुनर्जीवित दिग्गजों को जमा कर रहे शत्रु के विरुद्ध गठबंधन की तैयारियों का चित्रण करता है।

Sasuke के साथ द्वंद्व तब टूट जाता है जब Naruto, Sakura को घातक वार से बचाता है, और Tobi द्वारा Sasuke को Itachi की प्रत्यारोपित आँखें दिलाने के लिए ले जाए जाने से पहले पुरानी टीम संक्षेप में फिर से मिलती है। Orochimaru की मृत्यु की खबर Konoha पहुँचती है, Tsunade अपने कोमा से जागती है ठीक तब जब बुजुर्ग नए Hokage को नामित करने की तैयारी कर रहे होते हैं, और गाँव युद्ध की तैयारी में जुट जाता है। Mount Myoboku पर बुलाए जाने पर Naruto को एक द्वीपीय स्वर्ग और शक्तिशाली आँखों वाले युवक की भविष्यवाणी मिलती है, फिर वह यह मानते हुए अपनी सील की चाबी स्वीकार करता है कि वह Nine-Tails को वश में करने के लिए तैयार है।

नेता दोनों मेजबानों को एक छिपे हुए द्वीप पर सीमित करने का निर्णय लेते हैं, जहाँ Killer B अंततः Naruto को सिखाने के लिए सहमत होता है। Falls of Truth पर Naruto अपने ही एक कटु प्रतिबिंब का सामना करता है और Eight-Tails के साथ Motoi के पीड़ादायक इतिहास को सुनने के बाद उस अंधेरे स्व को गले लगाकर उस पर विजय पाता है। फिर वह अपने मन में मुक्त लोमड़ी से कुश्ती करता है, Sage Mode और B की सहायता लेते हुए, जब तक कि उसकी माँ Kushina की आत्मा प्रकट होकर जीव को बाँध नहीं देती और अपना chakra नहीं देती। Naruto लोमड़ी की शक्ति को पुनः प्राप्त करता है, उस रात का पूरा सत्य जानता है जब उसे मेजबान बनाया गया था, और कृतज्ञता तथा अपने माता-पिता से आगे निकलने के वादे के साथ Kushina से विदा लेता है।

Naruto की नई संवेदन क्षमता Kisame को उजागर कर देती है, जो Samehada के भीतर छिपा था, Guy द्वारा Daytime Tiger से उसे हराने के बाद तलवारबाज अपनी खुफिया जानकारी सौंपने के बजाय स्वयं को डुबो देता है, हालाँकि जाल से लैस एक स्क्रॉल फिर भी उसके एकत्रित रहस्यों को शत्रु तक पहुँचा देता है। Amegakure में Konan, Nagato के शरीर की रक्षा के लिए विस्फोटक ताबीजों के विशाल बिछाव से Tobi पर घात लगाती है, फिर भी Izanagi उसे जीवित रहने देता है, और वह उसे मारने के बाद Rinnegan पर अधिकार कर लेता है। पुनर्स्थापित और नया मुखौटा पहने Tobi, Kabuto को चेतनाहीन Hashirama क्लोन और सीलबंद जीवों के chakra की कीमत पर उगाई गई लगभग एक लाख White Zetsu की सेना दिखाता है।

Kabuto, Wood Release से उस सेना को मजबूत करने के लिए Yamato को पकड़ लेता है और उसकी संख्या और बढ़ाने के लिए पतित Akatsuki, पूर्व मेजबानों, Kage और प्रसिद्ध शिनोबी की एक सूची को पुनर्जीवित करता है। जब दोनों गठबंधन अपनी सेनाएँ सजाते हैं और टोही दल शत्रु की मांद को Mountains' Graveyard पर चिह्नित करते हैं, तो पुनर्जीवित भीड़ कूच करती है और युद्ध शुरू होने को तैयार खड़ा होता है।