心臓の鼓動が聞こえる

謎の巨人が外で同類を倒し続ける中、本部に閉じ込められた訓練兵たちは古い銃の保管庫を発見する。アルミンはそれらを中心に作戦を組み立てる。第1班がエレベーターで補給室に降りて7体の小型巨人を誘い込み、至近距離からその目を撃ち抜き、天井の梁に控えた7人の第2班が視界を奪われた標的のうなじに飛びかかるというものだった。リスクに不安を募らせるアルミンだったが、ミカサは彼の思考がこれまでも自分やエレンを危機から救ってきたことを思い出させ、彼を勇気づける。罠は仕掛けられ、7回中5回の攻撃が完璧に決まる。サシャとコニーは削ぎ切りに失敗するが、誰も死ぬことなくミカサとアニが手負いの巨人を仕留める。部屋の安全が確保され、全員がガスを補給する。

一行が脱出の準備を進める中、ミカサは窓辺にとどまり、自分たちを救った謎の巨人に他の巨人が群がり喰らいつく様子を見つめ、その謎が失われることを惜しむ。ライナーは介入を主張し、アニも味方となる巨人のためならリスクを冒す価値があると同意するが、ジャンは化物に命を懸けることに難色を示す。しかし、謎の巨人が群れの中から飛び出し、トーマス・ワグナーを喰らった巨人に襲いかかってそのうなじを噛み砕き、その死体を棍棒のように使って別の巨人を攻撃した後、ついに力尽きて倒れたことで議論は終わる。

巨人が味方になるはずがないとジャンが繰り返した直後、巨人の首元から湯気が吹き出し、肉体の中から一人の人間の身体が現れる。失ったはずの手足が元通りになったエレンだった。ミカサは駆け下りて彼を抱きしめ、その胸に耳を当てる。そこで感じた心臓の鼓動に彼女は涙を流し、彼を屋上へ運び上げて泣き崩れる。アルミンは再生した手足に気づき、他の者たちは横たわる巨人の死骸を見つめながら、それらすべてを殲滅したのがエレンだったことを徐々に理解していく。

アルミンは立体機動装置を使わずに補給室の7体の巨人を退治するため、目を狙撃する伏撃作戦を考案する。

サシャとコニーの攻撃が失敗した後、ミカサとアニが二人を救出する。

訓練兵たちはガスを補給し、本部から脱出する。

謎の巨人はトーマス・ワグナーを喰らった巨人を倒し、疲労困憊して倒れる。

エレンが失われた手足を再生させた状態で謎の巨人のうなじから生きて現れ、自分がその巨人であったことを同級生たちに明かす。

心臓の鼓動が聞こえるは諫山創による作品で、第2巻の5番目のエピソードであり、シリーズ通算第9話として同巻を締めくくる。日本では2010年5月9日に刊行され、英語版はトロスト区攻防戦編の一部として2012年9月11日に発売された。アニメでは『心臓の鼓動が聞こえる（トロスト区攻防戦④）』として映像化されている。

本作は『咆哮』の後に続き、物語は特別編『リヴァイ兵士長』とともに『左腕の行方』へと続く。