生命の樹

母星での絶滅に直面した第一始祖民族は、銀河各地の選ばれた惑星に向けて7つの生命の種を送り出した。それぞれの種には、始祖民族自身の遺伝物質に基づく新たな生命を創造し、創生者が滅び去った後もその存在を残すという任務が与えられていた。種は「月」あるいは「卵」と呼ばれる巨大な球体内部に納められて旅立ち、必要が生じた際に種を機能停止させられる、生命を宿したかのような兵器「ロンギヌスの槍」がそれぞれに一本ずつ配備されていた。

TVアニメ本編では2種類の種が提示される。第一の種は「生命の実」であるS²機関（スーパーソレノイド）を宿し、底なしのエネルギーと絶大な物理的権能を与える。アダムはこの系譜に属し、その仔らである使徒たちもその強大な力を受け継いでいる。第二の種は「知恵の実」である理性や科学的思考力を宿す。リリスはこの系譜であり、その仔らには人類が含まれる。人類は肉体的には脆弱でありながら、力に頼るのではなく技術によって世界を作り変え、文明を築く存在である。

両方の実を同時に保持する単一の存在は、第一始祖民族そのものに匹敵する神のごとき領域に近づく。それを防ぐため、第一始祖民族は「いかなる惑星も2つ以上の種を宿してはならない」と定めた。万が一、2つの種が同じ世界を共有することとなった場合、ロンギヌスの槍が最初に到達した種以外のすべての種を機能停止させ、最初に届いた種だけをその惑星の生命の唯一の源泉とする手筈となっていた。

知られている種は2つのみであり、その双方が地球に到達した。生命の実を携えたアダムは本来この惑星に配備されるはずだった種であり、現在の南極大陸の下にあるホワイトムーンに着陸した。一方、知恵の実の保持者であるリリスは、それを運ぶブラックムーンが将来の日本・箱根エリアとなる地域に激突したことで偶然到達した。この衝突は第一インパクトとして記憶されている。

リリス自身の槍はその激突の際に紛失または破壊されたため、第一始祖民族の掟の執行はアダムの槍へと委ねられ、この惑星への正当な権利を持っていたにもかかわらずアダムは封印された。アダムが仮死状態にある間、リリスの血であるLCLが惑星の原始のスープとなり、数億年の時を経てリリス由来のあらゆる生命の系譜を生み出し、最終的に知性体であるリリン（人類）へと至った。アダムは2000年に葛城調査隊によって呼び覚まされ、第二インパクトと呼ばれる大災害を引き起こすまで南極の地下に眠り続けた。厳密に言えば、使徒とは定義上「生命の実を宿したアダムの仔」を指すため、アダムもリリスも使徒には該当しない。