碇シンジ

整ったストレートの茶髪の下から、グレーブルーの瞳が覗いている。シンジの体格は細身で華奢に近く、シャツの裾をズボンに入れる習慣からは几帳面な性格が窺える。本部で過ごす時も街を歩き回る時も、青いTシャツの上に白いワイシャツを重ね、ダークカラーのズボンと白いスニーカーを着用しているが、自宅ではよりゆったりとした服に着替える。彼のプラグスーツは、淡い青の胸部と、黒のパネルで区切られた濃い青の四肢を組み合わせたデザインとなっている。

先生の静かな家庭で過ごした歳月はシンジを受動的で従順にし、NERVにおける彼の最初の行動は拒絶であった。彼は初号機に関わることを何よりも嫌がった。どれほど本人が強く否定しようとも、最終的に彼をエントリープラグへと向かわせたのは承認欲求、とりわけ父親からの承認を求める気持ちであった。心の内で繰り返す「逃げちゃダメだ」という言葉は、自分自身への戒めであると同時に、過去にとらわれるのを止めたいという叫びでもあった。

見捨てられたという経験が彼を形作った。自分が不十分だったから置き去りにされたのだと思い込んでいる彼は、精神的な痛みや憎しみ、そして見捨てられることを極度に恐れている。他者からかけ離れて育ったため、大勢が集まる場所ではあからさまに居心地悪そうに漂う。現実の世界が迫りすぎると、彼はSDATプレイヤーのヘッドホンの内側に閉じこもる。しかし、彼は冷淡でも不親切でもない。物腰は柔らかく、自らの欠点を痛いほど自覚しており、正確な記憶力にも恵まれた彼は、なぜ使徒と戦わなければならないのかという理由を模索し続ける唯一のパイロットである。コックピットからの逃避でさえ、他者に危害が及ぶのを防ごうとする試みであることが多く、窮地に陥った際には、一人を救うために自分自身を含む多くの命を危険に晒すことすらある。

シンジが3歳頃の時、目の前で行われた接触実験によって母が初号機に取り込まれる。ゲンドウは少年を先生の元へと預け、11年後、ほとんど何も書かれていない手紙で彼を第3新東京市へと呼び出す。シンジは操縦を拒否するが、担架で運ばれる血まみれで包帯姿の綾波レイの姿を見てエントリープラグへと乗り込む。サキエルとの戦いではほぼ即座に意識を失うが、暴走した初号機が彼なしで勝利を収める。葛城ミサトは彼を一人にせず自分のマンションに引き取り、学校ではトウジとケンスケという友人を得る。

戦いは激しさを増していく。彼は市街地をパニック状態で暴走した末にシャムシェルを倒し、レイが盾となる中で陽電子砲を用いてラミエルを破壊し、新しくやってきたアスカと共にイスラフェルとの戦いに向けて連日のシンクロダンス特訓を強いられることで協調性を学ぶ。サンダルフォンから彼女を救うために火山の中にナイフを落とし、落下するサハクィエルを支え、レリエルの影にエヴァごと引きずり込まれるが、初号機自らが引き裂いて脱出する。彼のシンクロ率はついにアスカを追い抜き、自信を得た矢先にそれが打ち砕かれる。ゲンドウのダミープラグが、トウジの乗った使徒侵食済みの3号機を惨殺し、憤怒したシンジはNERVを去る。加持の説得により彼はゼルエル戦へと復帰し、暴走した初号機は使徒のS²機関を喰らい、さらにはシンジの肉体をコアへと取り込む。彼はエヴァの中に母の存在を感じ取ることでようやく帰還を果たす。アルミサエルの攻撃によってレイは命を落とし、彼女のクローンたちの存在が露わになり、そして新たにできた唯一の友人である渚カヲルが最後の使徒であると判明したことで、シンジの心は完全に打ち砕かれる。カヲル自身の望みにより、シンジは初号機の握力で彼を押し潰す。

TVアニメ版の結末は内面へと向かう。人類補完計画へと導かれたシンジは、自らの自己嫌悪に向き合い、個人としての価値を受け入れ、生きることを選択する。『新世紀エヴァンゲリオン劇場版 Air/まごころを、君に』はその選択を現実の肉体として描く。ミサトの死とサードインパクトを経て、レイは補完計画の主導権をシンジの手に委ね、彼は融合した人類を拒絶し、互いに傷つけ合う個別のリアルな他者が存在する世界を選び、アスカの傍らの海岸で目を覚ます。

貞本義行による漫画版では、彼はより怒りっぽく皮肉屋で、感情を爆発させやすくレイに親しいキャラクターとして描かれ、作り直された世界でスーツケースにミサトのペンダントを結びつけて再出発する結末を迎える。『育成計画』から『学園堕天録』、ゲーム作品に至るスピンオフでは自由に再解釈がなされ、『ヱヴァンゲリヲン新劇場版』シリーズでは彼の物語が最初から再構築される。貞本は彼を『ふしぎの海のナディア』のナディアの男性版としてデザインし、庵野秀明は彼を自身の自意識の投影として書き上げ、その名前はアニメーターの樋口真嗣に由来している。