聖母

スカーはエドワードをリオールの死者の墓へと案内し、この悲劇に対する彼の責任を思い出させ、軍が想定していなかったイシュヴァールの血を町の人々が引いていることから、賢者の石の錬成を完成させて軍の暴政を終わらせなければならないと主張する。前線基地では、マルテの遺体がアルフォンスの鎧から運び出され、学んだことを説明できないアルは、ホムンクルスである大総統がイシュヴァールと同様にリオールを焦土化しようとしているという彼女の警告と、自ら目にしたウロボロスのマークを思い出す。見張りを受ける中、エドは口のきけないロゼが人々をまとめて町の「聖母」となったことを知るが、誰かの命令に従っている限り何も変わらないと主張し、密かにアルへ手紙を送る。

マスタング組は、スカーが第5研究所の秘密を再現し、兵士たちを犠牲として消費するための錬成陣に街全体を作り変えたことを解読する。返却された銀時計にタッカーによって赤い石が仕込まれているとは知らず、アルはエドの増援として派遣される。キンブリーは陽動としてリオールを攻撃するため、タッカーが錬成したばかりのキメラを引き連れて到着する。スカーは人々を避難させるためにエドを解放し、一人で立ち向かう。キメラを倒したスカーは、自分に傷を負わせ、かつて兄の移植された腕の持ち主であった男としてキンブリーと対峙する。地下道では、エドと避難する町の人々がスロウスとラースに襲われる。ラースは自らの死産の遺体が扉の向こうへ消えたため弱点はないと誇る。地上では、アルがキンブリーを石の手で閉じ込め単なる殺人鬼だと糾弾するが、その隙にキンブリーは脱出し、スカーの左腕を錬成して復讐の罠を仕掛ける。スカーはその腕を引きちぎり、破壊の錬金術をキンブリーの胴体に叩き込んで致命傷を負わせる。死に際の錬金術師はエドの赤い石の時計を奪い取って投げつけ、スカーを遠ざけつつアルの鎧を爆弾へと変え始める。下水道では、スロウスがエドに対して自分を「正しく錬成しなかった」と認め、失敗した人体錬成のトラウマでエドは動けなくなる。その時ロゼが声を取り戻し、ラースが彼女とその子供を殺そうと迫る。

アイキャッチにかかわらず、この2003年版のエピソードは実際には作中タイトル「聖者」（The Scar）を冠しており、原作第30話からの翻案内容を含んでいる。本話はシリーズ第3期の最後を締めくくり、エンディングテーマが「I Will」に変更される前の第3期エンディング曲の最後の使用となった。「聖母」という名称はロゼ・トーマスを指している。