さようなら

工場ではスロウスのいまわの際の言葉がラースを打ちのめし、混乱の中でエンヴィーがウィンリィの姿で現れ、アルフォンスを奪い去ってダンテのもとへと運び去る。ラースがエドワードに復讐を果たそうとするとイズミが駆けつけてホムンクルスを追い払い、弟を救出するための協力を申し出る。ラストとスロウスの双方が消え去り、ダンテの創造物と主人は残り4体となり、エドワードは居場所を特定できる唯一の敵であるブラッドレイ大総統をまず討つことを決意する。

セントラルでは、ラッセルが本屋でエドワードの名を騙るが、その名が指名手配犯のものであることを知らずにトラブルに巻き込まれ、トリンガム兄弟は投獄される。遥か北方では、アームストロングが少数の兵士を率いて大総統に対する偽装反乱を起こすが、その場のマスタングとホークアイが実は変装したハボックとフューリーであるという偽装が施されていた。ブラッドレイは反乱を忠誠心のテストとして一蹴し、息子の誕生パーティーに向かう前に、逮捕された子供たちの処刑を命じる。

ロスとブロッシュはラッセルとフレッチャーを牢から脱出させ、中央司令部への襲撃が大総統の不在により不発に終わったエドワードとイズミを匿う。トリンガム兄弟は隠された場所を示す父親の手記の1ページを明かすが、リオールでの負傷後に身体の半分を機械鎧で改造されたサイボーグ・アーチャーが壁を突き破って出現し、再会は破られ、イズミが彼を食い止めるために留まる。屋外でエドワードはマスタングの車に乗り込み、大佐が自身の野望を犠牲にしてでもヒューズの仇を討つ覚悟であることを知り、夢を諦める共通の覚悟を認識する。二人は最後の別れを告げ、それぞれの道を歩み始める。

エンヴィーがウィンリィの姿でアルフォンスを連れ去り、残り4体のホムンクルスとその主人のみが生き残る中、イズミは彼を取り戻すためのエドワードの行動に加わる。ラッセルがエドワードを騙ったことでトリンガム兄弟は投獄されるが、ロスとブロッシュによって救出される。アームストロングと変装した士官たちが北方で囮の反乱を起こす一方、ブラッドレイは捕らえられた子供たちの処刑を命じる。リオール後に改造されたサイボーグのアーチャーが襲撃するがイズミが食い止め、エドワードとマスタングは別れる前に最後の別れを告げる。

本エピソードではフランク・アーチャーの生存と変貌が明かされ、リオールで負った傷のために身体の半分以上が機械鎧に置き換えられている。また、エドワードとマスタングがそれぞれの最終的な道を進むことになり、両者が賢者の石の陰謀を終わらせるために自らの野望を捨てる覚悟を決める様子が描かれる。