レイ・シス

シスはアヤナミシリーズの中で最も小さな体を持ち、7歳相当の体格である。その体格はコックピット内で実用上の問題を引き起こし、自身の機体以外のエヴァンゲリオンに乗る際は、手が操作部に届くようエントリープラグを改修しなければならない。通常は護衛や世話係としてType-Nロボットの部隊が同行している。

本来は自ら思考する設計ではなかったが、レイ・キャトルの精神汚染がクローン全体に拡大したことでシスにも人格が芽生えたものの、その精神は不安定なものであった。周囲の人々は愛情をもってそれを補おうとする。肉体・精神年齢が近いマリと深く打ち解け、トウジやレイ・サンクに対してはきょうだいのような愛着を抱き、ヒカリとも友人となる。特にサンクの安定した存在はシスの不安定な精神を支える重要な重しとなり、ミサトからはその小柄な体格から「チビ波」というあだ名でからかわれている。

シスは、SEELEによるNERV本部襲撃後に人工子宮で育成されたアヤナミクローンの一群から誕生した。魂を持たない肉体が無意識に魂を持つオリジナルの動作や脳活動と同調することに着目したNERVはメンタルミラーリングシステムを構築し、レイ・トロワがシスを含む妹たちを遠隔操作して操縦を行っていた。他のクローンとは異なり、彼女は無重力空間での戦闘に特化して育成された。汚染による精神の不安定さが周囲の職員を心配させるものの、NERVは彼女を全面的にバックアップし、当初は零号機0.0（シス）に搭乗し、後にエヴァンゲリオン零号機F型へと移籍した。