Battaglia Fatale tra Fratelli

Conosciuto nell'anime come Profezia del Maestro e Vendetta, questo arco è incentrato sullo scontro tra Sasuke e suo fratello Itachi. Si estende nei volumi dal quarantadue al quarantaquattro della Seconda Parte, seguendo la Storia di Jiraiya l'Eroico, e intreccia il duello tra fratelli, la verità sepolta degli Uchiha e il lutto di Naruto.

Sasuke rintraccia Itachi nel vecchio nascondiglio degli Uchiha e il loro combattimento si snoda attraverso strati di genjutsu e scambi elementali, la Palla di Fuoco Suprema contro l'Amaterasu, un Kirin alimentato dalla tempesta e il Susanoo di Itachi che brandisce la Spada di Totsuka. Quella lama sigilla Orochimaru, che erompe dal corpo di Sasuke dove si era annidato fin dal suo fallito tentativo di impossessarsene. Itachi insiste nonostante un evidente male nascosto e, quando finalmente raggiunge il fratello esausto, si limita a dargli un colpetto sulla fronte, mormora delle scuse e muore in piedi.

Sasuke si risveglia e trova Tobi ad attenderlo, che afferma di essere Madara e offre la vera storia. Racconta l'antica guerra tra Uchiha e Senju, la fondazione di Konoha e la defezione di Madara, poi rivela che Itachi ha sterminato il loro clan su ordine degli anziani del villaggio per prevenire un colpo di stato, risparmiando solo il fratellino. Lungi dall'essere un criminale, Itachi si era addossato l'infamia per proteggere sia Sasuke sia Konoha. Sconvolto dalla rivelazione, Sasuke ribattezza la sua squadra Taka e ne indirizza lo scopo alla distruzione del villaggio che ha usato suo fratello.

Altrove, un Naruto devastato apprende da Fukasaku che Jiraiya è caduto per mano di Pain ad Amegakure. Una visita alla futura mamma Kurenai lo rincuora, e aiuta a decifrare il codice lasciato da Jiraiya morente, scoprendo l'indizio che il vero corpo di Pain è nascosto altrove. Rispondendo alla chiamata di Fukasaku, Naruto si reca al Monte Myōboku e affronta l'estenuante addestramento che sblocca la Modalità Eremitica, perfezionando il suo Rasenshuriken e ideando un modo per mantenere quello stato nel mezzo di un combattimento.

Scegliendo di ricostruire il suo clan alle proprie condizioni piuttosto che reclamare gli occhi di Itachi, Sasuke guida i Taka sulle tracce dell'ospite dell'Otto Code, Killer B di Kumogakure, su ordine di Tobi. Braccano il jinchūriki nella Valle delle Nuvole e dei Fulmini, dove scoppia un feroce combattimento che porta avanti la storia.