Missione all'Inseguimento di Itachi

Nota nell'anime come Profezia del Maestro e Vendetta, questa trama si estende nei capitoli dal 343 al 367 attraverso i volumi dal 38 al 40, adattata negli episodi dal 113 al 118 e dal 121 al 126 di Naruto: Shippuden. Il manga arriva dalla Missione di Soppressione dell'Akatsuki, l'anime dall'Apparizione del Tricoda, ed entrambi proseguono nel Racconto di Jiraiya l'Eroico. Il suo doppio filo segue Sasuke Uchiha e Naruto Uzumaki mentre ciascuno, per ragioni diverse, si mette alla ricerca di Itachi Uchiha.

Dichiarando di non avere più nulla da imparare, Sasuke si rivolta contro il malato Orochimaru, costringendolo ad abbandonare il suo corpo in rovina e a rivelare la sua vera forma serpentiforme. Quando il giovane indebolito dal veleno viene inghiottito interamente per un trasferimento forzato del corpo, Sasuke invece prende il controllo della dimensione con i propri occhi e ritorce la tecnica contro chi l'ha lanciata, lasciando Orochimaru distrutto. Libera quindi Suigetsu, recluta la sensitiva Karin e sottomette l'instabile Jugo, formando la squadra che chiama Hebi con un unico scopo dichiarato: uccidere suo fratello.

A Konoha, la notizia della morte di Orochimaru convince Naruto e Sakura che Sasuke darà ora la caccia a Itachi, così il Team Kakashi e il Team 8 decidono di catturare l'Uchiha maggiore e seguirlo fino al loro amico. Kabuto intercetta il gruppo di Naruto per consegnare un dossier sull'Akatsuki, ringraziando il ragazzo per averlo aiutato a trovare la propria strada e rivelando di aver fuso parte dei resti di Orochimaru nel proprio corpo. Mentre entrambe le parti si sparpagliano per raccogliere informazioni, le due cacce iniziano a convergere sullo stesso bersaglio.

Deidara e Tobi tendono un'imboscata a Sasuke, e segue un lungo duello di esplosivi in cui Deidara ricorda di essere stato costretto a entrare nell'Akatsuki dopo aver perso contro lo Sharingan di Itachi. Spinto al limite, Deidara si trasforma in una bomba vivente, ma Sasuke fugge evocando Manda come scudo e teletrasportandosi in salvo a spese del serpente. Altrove Itachi invia due cloni, uno intrappola Naruto in una breve conversazione in genjutsu sul suo legame con Sasuke, l'altro mette alla prova Sasuke prima di indirizzarlo verso un vicino nascondiglio degli Uchiha.

Entrambe le squadre premono verso quel punto d'incontro. Il gruppo di Naruto viene bloccato da Tobi, mentre Kisame interviene per tenere occupato il resto di Hebi, lasciando Suigetsu a combatterlo per Samehada. Con i compagni trattenuti, Sasuke prosegue da solo e si prepara allo scontro con Itachi verso cui l'intera caccia lo ha condotto.