編

イーデン校の入学試験は、結成されたばかりのフォージャー偽装家族を試練に巻き込む。第3話から第6話にかけて、ロイドはヨルとアーニャに洗練された上流階級のマナーを叩き込み、屈辱的な家族面接を乗り切り、熟練のスパイであっても6歳児の行動を完全にシナリオ通りにはできないことを思い知らされる。

テロ組織「赤いサーカス」の残党がイーデン校の1年生が乗ったバスをジャックし、今回ばかりはロイドもヨルも救出に駆けつけることができない。首に爆弾首輪をはめられ、恐怖に怯えるクラスメイトたちを乗せたバスの中で、アーニャは自らの手でハイジャック犯を説得しなければならなくなる。

戦争を再発させる力を秘めていると噂される機密文書がコレクターの金庫にある絵画の裏に隠されており、そこへ侵入する唯一の方法は地下テニス大会への出場だった。ロイドは同僚エージェントのフィオナ・フロストとペアを組むが、彼女の本当の狙いは絵画ではなく彼の妻の座だった。

「いばら姫」は豪華客船プリンセス・ローレライ号に乗り込み、殺し屋で満ちた船内でマフィアの生き残りとその幼い息子を護衛する。そこへ福引きでチケットを当てたロイドとアーニャがタラップを登って現れ、ヨルは家族に決して気づかれることなく甲板上で極密の戦いを繰り広げなければならなくなる。

『SPY×FAMILY』の22番目となる現在進行中の本編は、病床に伏すロイドと捜査に動くフィオナの姿から始まる。バーリント総合病院で開催される神経学シンポジウムは、シグムンド・オースティンの過去の医療人脈に関する手がかりをもたらすと思われたが、事態は急変し、ドノバン・デズモンド本人が病院へと姿を現す。

アーニャの最初のステラ獲得のご褒美は犬になるはずだった。しかし彼女は偶然にも学生テロ組織に関わることになり、未来が見える巨大な白い犬と心を通わせ、ロイドの命を奪い西国と東国を再び全面戦争へと引き戻しかねない爆破テロを防ぐために奔走する。

アーニャのイーデン校での最初の数日は異例の速さで波乱の展開を迎える。ベッキー・ブラックベルという親友ができる一方で、ダミアン・デズモンドの顔面にパンチを叩き込み、授業がまともに始まる前に雷（トニトラス）を食らってしまう。一方ロイドは、任務全体が8つの星（ステラ）を集める6歳児にかかっていることを知る。

偽造された写真によってハウスマスター（寮長）のヘンリー・ヘンダーソンが試験の解答を売却したという濡れ衣を着せられ、イーデン校で最も厳格な教師が失意のうちに辞職する。彼の身の潔白を証明する役割は、最も小さな擁護者たちであるアーニャと同級生たちに託され、彼らは噂の旧校舎を通じてでっち上げの真相を追っていく。

オスタニアの大ヒット恋愛ドラマの生放送観覧チケットを手に入れたことで、ロイド、ヨル、ユーリは同じスタジオ観覧席に居合わせることになるが、まさにその時、武装した狂信者グループがテレビタワーを占拠する。彼らの要求は金でも政治でもなく、番組の台無しにされた最終回を生放送で撮り直すことだった。

デパートの階段での偶然の救出劇が、オペレーション〈梟（ストリクス）〉にこれまでで最大の転機をもたらす。ヨルは任務の難攻不落の標的の妻であるメリンダ・デズモンドと友達になる。ロイドはその繋がりをプランCへと発展させる一方、母に先を越されることを恐れたアーニャは、ダミアンへのアプローチをさらに強める。

イーデン校の限定懇親会により、黄昏は正体を隠し通したまま接触を図ることができれば、初めてドノバン・デズモンドに近づく機会を得る。その果てには「オペレーション〈梟〉（ストリクス）」の標的とのぞっとするような初の会話と、ダミアンと父親の間に見られた貴重な温もりの瞬間が待っていた。

外交官の死によってウェスタリス（西国）は開戦の危機を確信し、同国最高峰のスパイに極秘の荒唐無稽な任務が下される。それは急遽「妻と子供」を調達し、名門校へと潜入することだった。黄昏は超能力者を養子にし、暗殺者と結婚するが、どちらの秘密にも気づくことはなかった。

『SPY×FAMILY』の第11編目のストーリーアークでは、フォージャー家を支える男の過去へと迫る。軍犬のしつけ、炎上するアパート、アーニャの2個目のトニトリス（雷）の合間に、ロイドは普通の少年を「黄昏」と呼ばれるスパイへと変えた、ルーウェンでの爆撃された少年時代の夢を見る。

『SPY×FAMILY』の第16編目のストーリーアークでは、イーデン校の2人の老人物が秘められた過去を共有する。ヘンリー・ヘンダーソンとマーサ・マリオットの物語は、お茶会、伏字にされたラブレター、そして互いの想いを言葉にする前にふたりの運命を決した最初の東西戦争を通じて、約50年前へと遡る。

成績上位者にはステラが授与され、赤点にはトニトラスが科される。『SPY×FAMILY』第7の長編では、イーデン校の中間テストによってオペレーション〈梟（ストリクス）〉が危機に瀕する。テスト当日にアーニャは超能力を失い、ヨルは料理を学び、自称ライバルのポンコツスパイ〈東雲〉がロイドより先に答案保管庫へ侵入する。

『SPY×FAMILY』第18の長編において、〈いばら姫〉はバーリントから遠く離れた地で〈ガーデン〉の依頼を引き受ける。絶滅危惧種のミテラエルクを密猟者から守るために派遣されたヨルは、一匹狼のアサシン・ヘムロックを相手に自身の結婚生活を守る闘いを強いられ、その戦いはロイドが自分にとって本当にどのような存在なのかを見つめ直すきっかけとなる。

『SPY×FAMILY』第4の長編では、東国の秘密警察がフォージャー家の食卓に現れる。ヨルを溺愛する弟ユーリは、実は〈黄昏〉を追うSSS（国家保安局）の中尉であることが判明し、彼の酔っぱらった訪問によって、偽装夫婦は心の準備ができていないキスで自分たちの結婚を守ることを強いられる。

ロイド・フォージャーは『SPY×FAMILY』の第21編目のストーリーアークにて、秘密警察で満たされた部屋へと足を踏み入れる。ユーリは同僚たちがロイドをヨルにふさわしい男か見極めさせるため、義理の兄を週末のパーティーに連れ出す。凄腕スパイは酔っ払いたちや変装した局長、そして自身の麻酔針時計をかわしながら一夜を過ごすことになる。

皇帝の学徒（インペリアル・スカラー）に選ばれるには8つの「星（ステラ）」が必要であり、『SPY×FAMILY』の第5章となる本エピソードでは、アーニャがその獲得に向けて奔走する最初の試みが描かれる。巨漢のビル・ワトキンスとのドッジボール対決は徒労に終わるものの、病院のプールで溺れる少年を助けたことでアーニャは初の「星」を獲得し、そのご褒美として犬をねだるのだった。

『SPY×FAMILY』の第17編目のストーリーアークでは学校が休みに入り、キャストの誰もが休暇のエピソードを迎える。エーベル川で迷子になったアザラシ、占い師になったメリンダ・デズモンド、そして夫をエイリアンと呼ぶ精神科の診察が、オペレーション〈梟（ストリクス）〉をロイドの予想だにしなかった方向へと押し進める。

『SPY×FAMILY』第15の長編では、アーニャの最初の期末考査がオペレーション〈梟（ストリクス）〉を破滅させかねない状況となるが、『スパイアニメ（Spy Wars）』の初版本を持つ高齢の新しい隣人が意外な家庭教師となる。古語の試験で彼女は学業初のステラを獲得し、学期はダンスとダミアンが信じようとしない告白とともに幕を閉じる。

WISE本部に潜むスパイがオペレーション〈梟（ストリクス）〉を暴き得る機密ファイルを盗み出し、『SPY×FAMILY』第14の長編は国境の町での大捜索へと展開する。ロイドとユーリはお互いの素顔を知らないまま地下水道で一騎打ちを繰り広げ、フィオナ・フロストは自らの骨を折りながらも裏切り者ウィンストン・ウィーラーを追い詰める。